61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2931 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  100 
 
 		 289 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  85.27 
 
 		 292 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  57.89 
 
 		 300 aa  328  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55.4 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  56.94 
 
 		 282 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55.4 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  54.67 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  54.67 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55.36 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  54.7 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  55.05 
 
 		 274 aa  298  8e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55.05 
 
 		 274 aa  298  8e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  54.7 
 
 		 274 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  53.9 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  75.9 
 
 		 375 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  74.4 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  57.83 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  58.33 
 
 		 377 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  56.29 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  58.24 
 
 		 398 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  65.55 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  50.56 
 
 		 376 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  51.74 
 
 		 353 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  48.9 
 
 		 371 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  49.21 
 
 		 179 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  55.97 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  58.27 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  66.96 
 
 		 372 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  61.54 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  72.57 
 
 		 390 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  71.6 
 
 		 80 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  29.73 
 
 		 447 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  22.09 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  22.3 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  28.26 
 
 		 230 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  55.93 
 
 		 69 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  29.31 
 
 		 543 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  24.47 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  33 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  29.17 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  39.74 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3811  hypothetical protein  24.72 
 
 		 389 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  31.53 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  33.33 
 
 		 501 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  31.37 
 
 		 438 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  29.59 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  23.87 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  22.59 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  26.92 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  34.12 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  25.37 
 
 		 359 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4926  hypothetical protein  30.07 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0096  hypothetical protein  21.19 
 
 		 367 aa  46.2  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  37.04 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0088  hypothetical protein  21.19 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  20.25 
 
 		 490 aa  44.3  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  28.63 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  21.92 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  23.9 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  23.48 
 
 		 328 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  27.47 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>