60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3256 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  100 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  100 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  96.45 
 
 		 282 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  92.86 
 
 		 294 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  92.52 
 
 		 294 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  79.93 
 
 		 274 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  78.83 
 
 		 274 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  78.47 
 
 		 274 aa  411  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  78.83 
 
 		 274 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  78.25 
 
 		 285 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  63.7 
 
 		 300 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  58.28 
 
 		 292 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55.86 
 
 		 289 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55.72 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  74.86 
 
 		 179 aa  248  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  41.19 
 
 		 353 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  68.46 
 
 		 323 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  77.97 
 
 		 371 aa  191  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  60.9 
 
 		 376 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  60.13 
 
 		 373 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  57.14 
 
 		 377 aa  178  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  57.69 
 
 		 376 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  60.27 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  60.27 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  59.86 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  55.97 
 
 		 375 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  68.14 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  58.02 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  64.91 
 
 		 390 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  84.81 
 
 		 80 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  49.03 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  30.89 
 
 		 447 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  26.67 
 
 		 208 aa  89.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  28.5 
 
 		 208 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  26.67 
 
 		 208 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  28.5 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  30.2 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  27.8 
 
 		 543 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  40.21 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  25.51 
 
 		 506 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  56.67 
 
 		 69 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  25.97 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  35.82 
 
 		 439 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  24.9 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  24.91 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  24.27 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  21.89 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  24.51 
 
 		 374 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  22.07 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  27.97 
 
 		 398 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  22.49 
 
 		 319 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  22.36 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  25.1 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  24.69 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  24.69 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  24.59 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  25.94 
 
 		 340 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  24.6 
 
 		 328 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  22.06 
 
 		 359 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  18.06 
 
 		 490 aa  42.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>