31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1104 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  142  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  81.36 
 
 		 253 aa  96.7  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  64.41 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  62.71 
 
 		 377 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  58.33 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  59.32 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  58.33 
 
 		 282 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  59.32 
 
 		 377 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  59.32 
 
 		 375 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  56.67 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55.93 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  56.67 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  56.67 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  56.67 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  55 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55 
 
 		 285 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  55 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  57.63 
 
 		 372 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  54.24 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  55.93 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  57.63 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  55.93 
 
 		 373 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  54.24 
 
 		 398 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  59.32 
 
 		 371 aa  57.4  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  56.86 
 
 		 353 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  56.86 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  56.86 
 
 		 354 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  52.94 
 
 		 390 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>