57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0067 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  100 
 
 		 300 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  68.14 
 
 		 294 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  68.47 
 
 		 294 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  65.76 
 
 		 282 aa  363  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  65.76 
 
 		 274 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  65.76 
 
 		 274 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  67.23 
 
 		 285 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  65.88 
 
 		 274 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  65.88 
 
 		 274 aa  351  7e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  65.88 
 
 		 274 aa  351  7e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  65.54 
 
 		 274 aa  350  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  57.89 
 
 		 289 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  61.36 
 
 		 292 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  50.14 
 
 		 376 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  54.36 
 
 		 253 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  50.78 
 
 		 323 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  83.19 
 
 		 371 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  59.8 
 
 		 179 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  67.18 
 
 		 373 aa  185  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  38.48 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  55.03 
 
 		 377 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  66.67 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  68.55 
 
 		 398 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  65.22 
 
 		 372 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  68.55 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  69.35 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  58.39 
 
 		 376 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  59.57 
 
 		 354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  66.17 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  61.74 
 
 		 356 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  76.83 
 
 		 80 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  29.96 
 
 		 447 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  33.9 
 
 		 543 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  26.39 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  43.48 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  31.82 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  54.24 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  32.69 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  29.09 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  35.58 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  37.89 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  37.31 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  35.58 
 
 		 501 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  23.24 
 
 		 390 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  32.81 
 
 		 231 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4926  hypothetical protein  30.3 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  27.03 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  24.26 
 
 		 374 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  32 
 
 		 438 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  24.02 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  24.41 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  32.86 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  24.41 
 
 		 328 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1782  high-affinity nickel-transporter  22.93 
 
 		 346 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  22.98 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3811  hypothetical protein  19.34 
 
 		 389 aa  42.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 236 aa  42.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>