49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2757 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  100 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  53.64 
 
 		 300 aa  287  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  54.61 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  54.61 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  54.24 
 
 		 274 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  54.24 
 
 		 274 aa  271  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  52.48 
 
 		 285 aa  271  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  53.9 
 
 		 289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  54.39 
 
 		 292 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  54.61 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  54.61 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  53.93 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  51.37 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  51.37 
 
 		 294 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  62.59 
 
 		 377 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  62.94 
 
 		 373 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  59.12 
 
 		 371 aa  164  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  61.94 
 
 		 376 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  60 
 
 		 376 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  57.86 
 
 		 372 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  49.15 
 
 		 179 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  61.29 
 
 		 375 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  57.35 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  65.49 
 
 		 390 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  60.28 
 
 		 371 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  62.1 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  65.14 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  62.81 
 
 		 354 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  51.68 
 
 		 323 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  64.55 
 
 		 398 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  73.97 
 
 		 80 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  81.36 
 
 		 69 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  24.66 
 
 		 208 aa  88.6  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  25.33 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  25.11 
 
 		 208 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  28.19 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  27.2 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  29.88 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  27.66 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  24.6 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  22.87 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  47.06 
 
 		 439 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  24.67 
 
 		 323 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  24.06 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  25.53 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  24.36 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4926  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  30 
 
 		 438 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  26.48 
 
 		 543 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>