63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4769 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 438 aa  838    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  35.14 
 
 		 543 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  37.5 
 
 		 447 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  31.65 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  28.9 
 
 		 208 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  27.71 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  29.59 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.04 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  35.14 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  32.63 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  34.01 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  27.75 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  29.74 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.45 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  44.94 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25.88 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25.49 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  25.49 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25.49 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25.49 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  24.49 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  61.43 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  24.09 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  45.76 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  24.44 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25 
 
 		 282 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  24.55 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  24.55 
 
 		 294 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  23.26 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  34.31 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  29.49 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  29.49 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  29.49 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  37.5 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  33.68 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  31.78 
 
 		 373 aa  53.5  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  26.82 
 
 		 345 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  27.73 
 
 		 340 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0285  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  32.57 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0371568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  34.07 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  34.69 
 
 		 372 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  22.76 
 
 		 293 aa  50.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  32.98 
 
 		 376 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  32.98 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  33.68 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  27.64 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  28.14 
 
 		 328 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  28.14 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  31.87 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  27.64 
 
 		 328 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  27.64 
 
 		 328 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  28.97 
 
 		 376 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0096  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  21.55 
 
 		 505 aa  47.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00355357  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1792  tRNA pseudouridine synthase B  19.53 
 
 		 497 aa  47  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  37.25 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3031  high-affinity nickel-transporter  25.12 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  16.43 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  35.29 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  31.4 
 
 		 372 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  31.52 
 
 		 356 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  27.37 
 
 		 233 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  36.84 
 
 		 80 aa  43.1  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>