70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3585 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 506 aa  1004    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  50.2 
 
 		 439 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  40.34 
 
 		 543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  36.22 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2537  hypothetical protein  39.76 
 
 		 358 aa  124  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.42829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  27.72 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  26.01 
 
 		 353 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  26.1 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.9 
 
 		 300 aa  88.6  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25.66 
 
 		 289 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  29.2 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  29.2 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  29.6 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  23.34 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.4 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.4 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.8 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26 
 
 		 274 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  23.41 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  26 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  25.09 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  26.81 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25.6 
 
 		 274 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.67 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  25.95 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  36.11 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  33.62 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  27.18 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  36.56 
 
 		 208 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  25.53 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  35.05 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  32.41 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  26.69 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  26.07 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  34.65 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  37.86 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  34.48 
 
 		 371 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  24.61 
 
 		 349 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  33.09 
 
 		 376 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  28.17 
 
 		 249 aa  53.9  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  42.62 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  39.39 
 
 		 356 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  23.88 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  34.04 
 
 		 230 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  23.88 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  53.49 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  23.88 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  37.68 
 
 		 513 aa  49.7  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  25.49 
 
 		 328 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  25.49 
 
 		 328 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  25.49 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  31.06 
 
 		 238 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  42.11 
 
 		 80 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  25.1 
 
 		 328 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  25.78 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4926  hypothetical protein  25.42 
 
 		 268 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1792  tRNA pseudouridine synthase B  23 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  25.1 
 
 		 328 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3677  high-affinity nickel-transporter  28.32 
 
 		 207 aa  47.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.841534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0081  high-affinity nickel-transporter  23.65 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.940198 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1079  permease  21.32 
 
 		 335 aa  45.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0887396  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3811  hypothetical protein  25.09 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  40.68 
 
 		 247 aa  44.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  24.82 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  30.53 
 
 		 345 aa  43.9  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4443  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.87 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2905  high-affinity nickel-transporter  23.35 
 
 		 381 aa  43.9  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  25.9 
 
 		 278 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  37.25 
 
 		 374 aa  43.5  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>