57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4186 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  50.21 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  28.71 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  29.63 
 
 		 208 aa  95.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  31.58 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  31.58 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  29.11 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  33.06 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  31.58 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  31.17 
 
 		 274 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.23 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  31.45 
 
 		 274 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  31.45 
 
 		 274 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  31.78 
 
 		 282 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  29.18 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  32.88 
 
 		 447 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.37 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.37 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.57 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  36.36 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  50 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  38.94 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  41.94 
 
 		 274 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  57.14 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  35.51 
 
 		 398 aa  58.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  50 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  38.78 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  34.75 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  35.77 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  30.45 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  48.21 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  33.96 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  26.81 
 
 		 543 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  48.15 
 
 		 371 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  33.94 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  53.06 
 
 		 376 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  27.06 
 
 		 319 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  36.89 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  43.86 
 
 		 80 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  48.98 
 
 		 377 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  30.34 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  26.07 
 
 		 374 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  21.3 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  37.33 
 
 		 506 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  27.65 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  37.8 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  28.68 
 
 		 621 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  27.1 
 
 		 328 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  27.1 
 
 		 328 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  35.29 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  23.62 
 
 		 345 aa  42  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  26.67 
 
 		 328 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  40.62 
 
 		 323 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  26.89 
 
 		 513 aa  41.6  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  26.64 
 
 		 328 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>