117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2923 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  421  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  62.15 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  62.39 
 
 		 220 aa  231  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  51.9 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  49.55 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  49.55 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  49.55 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  49.77 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  49.77 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  49.32 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  49.32 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  49.53 
 
 		 235 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  47.03 
 
 		 230 aa  188  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  49.1 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  47.49 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  47.22 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  48.4 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  45.74 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  48.82 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  50.68 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  53.5 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  53.54 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  42.04 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  51.58 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  44.19 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  55.05 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  43.81 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  47.74 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  43.13 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  45.54 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  40.44 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  43.07 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  45.66 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  53.89 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  40.85 
 
 		 249 aa  161  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  52.33 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  49.28 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2612  hypothetical protein  53.37 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471108  normal  0.594742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1814  hypothetical protein  51.81 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  45.7 
 
 		 279 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  49.22 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1994  hypothetical protein  50.78 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3828  hypothetical protein  51.81 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  50.24 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  40.95 
 
 		 239 aa  138  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  42.72 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  42.05 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1095  hypothetical protein  41.82 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4263  hypothetical protein  51.3 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  37.88 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3581  hypothetical protein  51.3 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1605  hypothetical protein  54.71 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.100156  normal  0.0122342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  37.88 
 
 		 344 aa  115  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  37.37 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  35.86 
 
 		 273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  39.41 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  36.94 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  34.58 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1355  putative transmembrane protein  40.25 
 
 		 239 aa  88.6  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550104 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0850  hypothetical protein  30.56 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  35.71 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  33.92 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1205  hypothetical protein  36.94 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  29.8 
 
 		 621 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  31.64 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  40.09 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1831  hypothetical protein  34.39 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  39.55 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0373  hypothetical protein  30.43 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1485  hypothetical protein  26.5 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  33.66 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  34.93 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2036  hypothetical protein  33.75 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1666  hypothetical protein  26 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.809334  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  36.52 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1841  hypothetical protein  26 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0115  hypothetical protein  35.15 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  28.92 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0238  hypothetical protein  36.12 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.563587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0800  hypothetical protein  32.08 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3376  hypothetical protein  37.17 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2033  transmembrane protein  34.4 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0096  hypothetical protein  35.96 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000827062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  32.83 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  27.32 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0467  hypothetical protein  32.44 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  26.51 
 
 		 499 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3557  hypothetical protein  34.31 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0172503  normal  0.774445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  33.04 
 
 		 409 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0792  hypothetical protein  32.3 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  27.01 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  27.94 
 
 		 471 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  29.3 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2489  integral membrane protein  28.64 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0864666 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1176  hypothetical protein  39.42 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.526094  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1236  hypothetical protein  38.94 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1338  hypothetical protein  38.94 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3773  hypothetical protein  30.65 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1009  hypothetical protein  32.75 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>