99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1095 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1095  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  366  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  50.57 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  46.71 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  38.1 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  37.7 
 
 		 226 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  42.24 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  42.24 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  36.72 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  37.2 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  37.58 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  37.43 
 
 		 230 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  39.63 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  34.94 
 
 		 230 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  40.24 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  36.67 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  38.29 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  37.65 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  38.25 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  36.87 
 
 		 230 aa  111  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  39.31 
 
 		 289 aa  111  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  35.09 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  36.31 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  35.5 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  35.09 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  35.09 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  35.59 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  34.94 
 
 		 234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2612  hypothetical protein  36.09 
 
 		 227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471108  normal  0.594742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  32.4 
 
 		 230 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  35.09 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  35.09 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  39.41 
 
 		 249 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  32.4 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  32.4 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  33.94 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  33.13 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1994  hypothetical protein  39.41 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  41.94 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  38.24 
 
 		 249 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  34.91 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  33.91 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  35.19 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  32.4 
 
 		 229 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  38.03 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1814  hypothetical protein  35.5 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  37.27 
 
 		 236 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3828  hypothetical protein  38.07 
 
 		 227 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  35.67 
 
 		 274 aa  95.1  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  31.76 
 
 		 219 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  35.37 
 
 		 344 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  33.92 
 
 		 273 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1605  hypothetical protein  39.2 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.100156  normal  0.0122342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4263  hypothetical protein  39.2 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3581  hypothetical protein  36.99 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  32.32 
 
 		 272 aa  84.7  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  27.12 
 
 		 621 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2297  ferric reductase domain-containing protein protein transmembrane component domain-containing protein  45.83 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  50 
 
 		 409 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0850  hypothetical protein  32.39 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  30.5 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1959  hypothetical protein  47.22 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178526  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  29.57 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  31.45 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  27.57 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  33.15 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1355  putative transmembrane protein  34.65 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550104 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  30.05 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1485  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0373  hypothetical protein  27.61 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  40.85 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  40.26 
 
 		 247 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1205  hypothetical protein  36.96 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1666  hypothetical protein  28.68 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.809334  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0238  hypothetical protein  29.61 
 
 		 393 aa  51.2  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.563587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  28.42 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  27.37 
 
 		 499 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1841  hypothetical protein  27.94 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  29.51 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  31.03 
 
 		 219 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1009  hypothetical protein  36.11 
 
 		 239 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2036  hypothetical protein  28.65 
 
 		 255 aa  47.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  28.09 
 
 		 224 aa  47.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1093  hypothetical protein  36.62 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  26.87 
 
 		 221 aa  47.8  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  32 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2784  hypothetical protein  30.09 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1160  hypothetical protein  31.09 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  30.12 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0720  hypothetical protein  29.19 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0477616  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5319  hypothetical protein  38.16 
 
 		 253 aa  45.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  26.14 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1176  hypothetical protein  29.23 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.526094  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2489  integral membrane protein  28.89 
 
 		 228 aa  42  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0864666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1532  hypothetical protein  32.39 
 
 		 261 aa  41.6  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1236  hypothetical protein  27.69 
 
 		 223 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3557  hypothetical protein  35.48 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0172503  normal  0.774445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1338  hypothetical protein  27.69 
 
 		 223 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0467  hypothetical protein  27.84 
 
 		 268 aa  41.2  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>