74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1160 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1160  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  362  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2784  hypothetical protein  68.85 
 
 
238 aa  228  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1093  hypothetical protein  58.82 
 
 
239 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1009  hypothetical protein  58.82 
 
 
239 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1532  hypothetical protein  68.52 
 
 
261 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1209  hypothetical protein  65.79 
 
 
244 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3773  hypothetical protein  56.5 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1939  hypothetical protein  49.5 
 
 
225 aa  151  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2825  hypothetical protein  51.67 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00604868  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2469  putative transmembrane protein  41.55 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2770  putative transmembrane protein  38.12 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  37.4 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  32.12 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  34.57 
 
 
344 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  35.97 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  32.6 
 
 
230 aa  57.4  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  34.81 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  31.39 
 
 
229 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  33.74 
 
 
273 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  32.5 
 
 
274 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  29.57 
 
 
230 aa  55.1  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  37.29 
 
 
227 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  32.54 
 
 
272 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  31.11 
 
 
230 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  31.11 
 
 
230 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  33.58 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  33.58 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  30.53 
 
 
230 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  33.58 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  33.58 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  31.11 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  34.55 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  30.29 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  37.72 
 
 
225 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  35.37 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  32.84 
 
 
235 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  32.61 
 
 
232 aa  51.6  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  30.36 
 
 
234 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  31.88 
 
 
230 aa  51.6  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2612  hypothetical protein  38.89 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471108  normal  0.594742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  35.59 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  32.56 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  32.48 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  30.43 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  35.77 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1095  hypothetical protein  27.53 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  32.64 
 
 
230 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  41.67 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  40.28 
 
 
239 aa  48.5  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1994  hypothetical protein  36.21 
 
 
227 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  58.54 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  34.3 
 
 
249 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1355  putative transmembrane protein  29.56 
 
 
239 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0550104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  31.3 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  28.99 
 
 
230 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  38.16 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  34.48 
 
 
226 aa  45.1  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  31.62 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  30.41 
 
 
224 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  30.68 
 
 
226 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  29.88 
 
 
249 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  27.71 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  34.68 
 
 
229 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0400  hypothetical protein  32.3 
 
 
297 aa  44.7  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  37.5 
 
 
279 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1814  hypothetical protein  33.73 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  37.5 
 
 
289 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  38.37 
 
 
248 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  42.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  53.49 
 
 
409 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2297  ferric reductase domain-containing protein protein transmembrane component domain-containing protein  52.38 
 
 
410 aa  42  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  28.26 
 
 
225 aa  41.6  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1727  hypothetical protein  34.51 
 
 
299 aa  41.6  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.029658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>