103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0800 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0800  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  517  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  40.61 
 
 
621 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  38.52 
 
 
499 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  39.37 
 
 
471 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  35.15 
 
 
228 aa  105  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  33 
 
 
221 aa  97.1  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  32.38 
 
 
226 aa  97.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  36.77 
 
 
409 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  35.68 
 
 
219 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  33.98 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  33.81 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2297  ferric reductase domain-containing protein protein transmembrane component domain-containing protein  33.62 
 
 
410 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0850  hypothetical protein  31.05 
 
 
211 aa  85.5  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1224  hypothetical protein  37.67 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.042848  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  33.65 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  30.92 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  33.96 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  32.41 
 
 
228 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0467  hypothetical protein  30.32 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0400  hypothetical protein  28.95 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1831  hypothetical protein  31.8 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  32.86 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  32.09 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  32.09 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  31.63 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  31.63 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0373  hypothetical protein  30.52 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0238  hypothetical protein  34.84 
 
 
393 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.563587 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  30.8 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  28.1 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  30.28 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  30.28 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  30.73 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  31.16 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  31.46 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  34.07 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  30.81 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  29.82 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  32.09 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  30.14 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  29.67 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  34.26 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  33.51 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  30.05 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1994  hypothetical protein  31.44 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  30.88 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1176  hypothetical protein  35.92 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.526094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  28.31 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5319  hypothetical protein  32.62 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  32.41 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3376  hypothetical protein  28.51 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  31.07 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  30.32 
 
 
225 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1236  hypothetical protein  36.41 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1338  hypothetical protein  36.41 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  34.55 
 
 
227 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  31.16 
 
 
230 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0899  hypothetical protein  31.22 
 
 
221 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  34.55 
 
 
227 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  31.6 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  28.26 
 
 
224 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  30.77 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1364  hypothetical protein  27.84 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  30.77 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1959  hypothetical protein  30.61 
 
 
423 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178526  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  30 
 
 
224 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  31.53 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  32.51 
 
 
221 aa  59.3  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  33.82 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  31.08 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  36 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0792  hypothetical protein  29.07 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2489  integral membrane protein  29.44 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0864666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1814  hypothetical protein  32.49 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0576  hypothetical protein  30.16 
 
 
279 aa  55.8  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0856861  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  30.73 
 
 
344 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  28.7 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  32.11 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  31.28 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  29.06 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  28.37 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3828  hypothetical protein  32.12 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4081  hypothetical protein  34.08 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3557  hypothetical protein  29.85 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0172503  normal  0.774445 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1666  hypothetical protein  23.9 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.809334  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  31.55 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  27.89 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  28.29 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1485  hypothetical protein  23.41 
 
 
219 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1841  hypothetical protein  23.41 
 
 
219 aa  48.9  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  29.17 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2612  hypothetical protein  34.38 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471108  normal  0.594742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  25.73 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2036  hypothetical protein  28.14 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0720  hypothetical protein  24.41 
 
 
214 aa  46.6  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0477616  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  27.71 
 
 
581 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  26.82 
 
 
289 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  29.38 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1205  hypothetical protein  26.61 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1605  hypothetical protein  41.79 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.100156  normal  0.0122342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>