61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2769 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 274 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  37.74 
 
 		 447 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  32.16 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  34.11 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  32.16 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  32.1 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  32.28 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  32.96 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  32.96 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  29.84 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.8 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  29.44 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  29.44 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.77 
 
 		 253 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  29.03 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  35.68 
 
 		 506 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  31.97 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  26.38 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  27.91 
 
 		 376 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  31.03 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  36.32 
 
 		 543 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  28.74 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  30.36 
 
 		 208 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  28.17 
 
 		 208 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  30.86 
 
 		 230 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  33.55 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  36.84 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  35.77 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  32 
 
 		 371 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  39.25 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  39.18 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  44.21 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  35.71 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  40.19 
 
 		 439 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  34.85 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  36.67 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  33.79 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  34.11 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  38.54 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  25.15 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  24.49 
 
 		 349 aa  52.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  24.53 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  24.53 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  24.53 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4926  hypothetical protein  22.22 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1782  high-affinity nickel-transporter  27 
 
 		 346 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  42.59 
 
 		 80 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  43.1 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  24.82 
 
 		 374 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  24.11 
 
 		 398 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  20.78 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3208  high-affinity nickel-transporter  26.75 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  24.09 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2905  high-affinity nickel-transporter  27.98 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  40.43 
 
 		 443 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  22.63 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  43.9 
 
 		 438 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  26.07 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  22.03 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  25.75 
 
 		 236 aa  42  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  26.38 
 
 		 372 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>