69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1541 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  99.64 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  98.54 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  90.53 
 
 		 285 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  78.83 
 
 		 274 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  78.83 
 
 		 274 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  76.24 
 
 		 282 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  72.79 
 
 		 294 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  73.47 
 
 		 294 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  99.44 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  63.85 
 
 		 300 aa  361  9e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55.9 
 
 		 289 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  58.42 
 
 		 292 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55.35 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  69.01 
 
 		 371 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  68.49 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  57.76 
 
 		 377 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  61.97 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  63.12 
 
 		 376 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  63.12 
 
 		 371 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  62.94 
 
 		 372 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  57.79 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  60.84 
 
 		 377 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  60 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  69.49 
 
 		 375 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  98.75 
 
 		 80 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  57.86 
 
 		 398 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  58.82 
 
 		 354 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  63.83 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  53.09 
 
 		 356 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  31.3 
 
 		 447 aa  92.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  30.84 
 
 		 227 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  26.23 
 
 		 208 aa  89  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  25.93 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  31.98 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  24.18 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  29.44 
 
 		 543 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  38.14 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  26.75 
 
 		 506 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  55 
 
 		 69 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  31.31 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  36.9 
 
 		 439 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  29.22 
 
 		 337 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1753  high-affinity nickel-transporter  26.72 
 
 		 329 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  23.65 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  24.19 
 
 		 358 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  25.1 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  23.33 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  23.33 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  23.33 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  19.73 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  23.44 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  25.48 
 
 		 359 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  21.69 
 
 		 374 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3692  high-affinity nickel-transporter  23.55 
 
 		 358 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  22.97 
 
 		 328 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  21.2 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  22.55 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  22.55 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  22.55 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  25.31 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  24.54 
 
 		 490 aa  44.3  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  23.39 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  22.91 
 
 		 345 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  25 
 
 		 364 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3031  high-affinity nickel-transporter  22.32 
 
 		 326 aa  42.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  30.88 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  25.91 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>