More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1450 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 338 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  61.24 
 
 		 308 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  61.82 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  59.82 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  55.52 
 
 		 330 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  53.59 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  55.62 
 
 		 325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  52.06 
 
 		 317 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  52.58 
 
 		 355 aa  269  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  55.76 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  49.41 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  53.75 
 
 		 330 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  52.98 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  45.86 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  51.37 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  46.44 
 
 		 325 aa  249  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  56.5 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  39.63 
 
 		 421 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  55.07 
 
 		 361 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  46.41 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  52.65 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  52.65 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  52.65 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  52.52 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  40.95 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  47.21 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  44.99 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  39.4 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  48.85 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  47.59 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  47.5 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  39.64 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  43.11 
 
 		 333 aa  189  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  66.91 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  68.67 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  60.81 
 
 		 318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  59.87 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  62.14 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  59.21 
 
 		 422 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  59.21 
 
 		 422 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  58.94 
 
 		 427 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  70 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  59.29 
 
 		 430 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  57.55 
 
 		 426 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  69.72 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 434 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  53.57 
 
 		 434 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  52.14 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  66.67 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  59.57 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  51.41 
 
 		 425 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  52.52 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  53.57 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  47.77 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  51.7 
 
 		 312 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  67.63 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  52.38 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  50.74 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  58.06 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 404 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  56.12 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  53.24 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  47.62 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  58.06 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  53.6 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  46.31 
 
 		 346 aa  125  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  33.02 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  52.38 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  30.85 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  25.08 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  48.87 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 		 299 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  25.38 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  27.05 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  28.89 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  31.58 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.38 
 
 		 299 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.38 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  25.16 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  52.8 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  25.47 
 
 		 299 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  25.47 
 
 		 299 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  25.08 
 
 		 299 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  27.37 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  27.37 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  27.37 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  31.29 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  31.58 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>