More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02793 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  100 
 
 
333 aa  658    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  64.56 
 
 
324 aa  345  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  56.19 
 
 
307 aa  334  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  58.79 
 
 
319 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  60.87 
 
 
312 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  58.88 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  55.62 
 
 
339 aa  285  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  51.68 
 
 
316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  55.49 
 
 
338 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  55.69 
 
 
319 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  44.69 
 
 
325 aa  269  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  48 
 
 
353 aa  261  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  45.97 
 
 
341 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  40.05 
 
 
421 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  51.11 
 
 
330 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  39.95 
 
 
425 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  45.19 
 
 
330 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 
309 aa  228  9e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  44.07 
 
 
317 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  44.55 
 
 
304 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  47.3 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  40.4 
 
 
369 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  48.39 
 
 
332 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 
318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  45.7 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  44.51 
 
 
309 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  48.31 
 
 
323 aa  212  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  47.5 
 
 
330 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 
312 aa  209  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  45.45 
 
 
337 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  45.45 
 
 
337 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  45.71 
 
 
337 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  46.36 
 
 
333 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  41.28 
 
 
365 aa  206  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  48.33 
 
 
337 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  47.04 
 
 
284 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  43.85 
 
 
318 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  45.45 
 
 
318 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  44.34 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  48.33 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  36.74 
 
 
303 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  43.89 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  45.81 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  48.29 
 
 
315 aa  196  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  44.67 
 
 
361 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  44.01 
 
 
320 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  38.41 
 
 
309 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  45.57 
 
 
315 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  42.25 
 
 
331 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  65.22 
 
 
351 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  42.46 
 
 
299 aa  179  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  44.91 
 
 
313 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  64.18 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  43.24 
 
 
274 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  47.67 
 
 
394 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  55.97 
 
 
306 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  52.05 
 
 
362 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  52.17 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  53.62 
 
 
387 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  52.9 
 
 
416 aa  139  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  52.9 
 
 
404 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  52.9 
 
 
394 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  47.02 
 
 
434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  47.02 
 
 
425 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  48.59 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  28.95 
 
 
299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 
398 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  28.94 
 
 
325 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  28.94 
 
 
325 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  52.38 
 
 
422 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  51.59 
 
 
422 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
434 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
434 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
312 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  51.59 
 
 
422 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  49.21 
 
 
434 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  29.31 
 
 
299 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
434 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  28.38 
 
 
317 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  28.29 
 
 
299 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.98 
 
 
299 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  43.37 
 
 
427 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  28.98 
 
 
299 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  28.98 
 
 
299 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  42.31 
 
 
419 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  48.55 
 
 
345 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.62 
 
 
299 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  28.62 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  30.46 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  30.46 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  30.46 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  46.31 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  28.48 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  27.92 
 
 
315 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  47.83 
 
 
426 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  27.61 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  46.31 
 
 
346 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  31.46 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 
327 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>