More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4322 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  100 
 
 		 303 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  50.31 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  47.4 
 
 		 341 aa  295  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  52.51 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  46.71 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  48.69 
 
 		 330 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 312 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  48.01 
 
 		 318 aa  258  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  47.4 
 
 		 325 aa  255  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  47.83 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  46.71 
 
 		 317 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  45.51 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  50.5 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  46.84 
 
 		 333 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  44.3 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  44.71 
 
 		 368 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  41.72 
 
 		 355 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  43.86 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  46.01 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  40.25 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  40.25 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  48.16 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  39.94 
 
 		 337 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  39.88 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  45.72 
 
 		 320 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  45.64 
 
 		 309 aa  227  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  44.69 
 
 		 337 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  45.13 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  43.65 
 
 		 330 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  45.51 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  39.42 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  45.85 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  44.34 
 
 		 317 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  39.52 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  42.9 
 
 		 331 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  47.25 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  46.69 
 
 		 284 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  45.13 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  40.27 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  41.93 
 
 		 315 aa  202  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  38.51 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  36.08 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  39.94 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  61.22 
 
 		 425 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  42.47 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  60.54 
 
 		 433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  60.54 
 
 		 421 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  63.19 
 
 		 404 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  63.19 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  63.19 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  63.7 
 
 		 362 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  41.86 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  63.83 
 
 		 387 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  67.39 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  62.41 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  70.3 
 
 		 369 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  51.08 
 
 		 427 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  49.32 
 
 		 434 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  48.63 
 
 		 434 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  48.63 
 
 		 434 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  48.63 
 
 		 434 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  48.63 
 
 		 434 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 426 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 		 338 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  47.14 
 
 		 382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 		 345 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  51.05 
 
 		 422 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  50.35 
 
 		 422 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 422 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  46.26 
 
 		 419 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  47.14 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  43.51 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  53.79 
 
 		 357 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  31.54 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  31.07 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  29.66 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  30.48 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  29.04 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  28.62 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  29.04 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  29.04 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  27.67 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  45.39 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 		 398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  25.17 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 352 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  28.29 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  30.42 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  27.99 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  30.07 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  30.07 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  30.07 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  27.99 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>