More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2106 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 404 aa  812    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  95.3 
 
 		 394 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  91.87 
 
 		 416 aa  621  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  86.14 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  71.93 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  71.66 
 
 		 421 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  72.08 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  77.56 
 
 		 369 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  60.21 
 
 		 341 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  46.95 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  88.74 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  46.54 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  40.67 
 
 		 353 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  76.51 
 
 		 325 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  79.17 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  74.15 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  71.25 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  70 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  63.83 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  60.96 
 
 		 312 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  58.7 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  41.67 
 
 		 306 aa  163  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  63.83 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  55.94 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  51.03 
 
 		 337 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  44.38 
 
 		 427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  49.66 
 
 		 316 aa  146  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  55.91 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  50.34 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  54.37 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  51.43 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  50.62 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  57.64 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  57.03 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  56.35 
 
 		 430 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  53.54 
 
 		 317 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  52.52 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  54.76 
 
 		 426 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  54.33 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  53.54 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  53.54 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  62.5 
 
 		 284 aa  136  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  47.52 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  51.75 
 
 		 318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  49.07 
 
 		 325 aa  133  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  49.23 
 
 		 434 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  49.23 
 
 		 434 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  44.83 
 
 		 382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  51.16 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  52.52 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  51.94 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  51.16 
 
 		 434 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  53.6 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  52.34 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  52.14 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  52.7 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  51.43 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  48.2 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  48.89 
 
 		 308 aa  126  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  43.15 
 
 		 432 aa  126  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 299 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  39.39 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  49.66 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  48.59 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  42.14 
 
 		 274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  47.92 
 
 		 315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  47.95 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45334  zinc- and cadmium resistance protein  23.31 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  23.67 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01795  CDF divalent metal cation transporter (Eurofung)  21.88 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  29.92 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  29.92 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  33.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  32.74 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 305 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  35.33 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  32.74 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  31.79 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  33.63 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  30.47 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>