More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0967 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  100 
 
 		 355 aa  700    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  58.73 
 
 		 317 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  64.63 
 
 		 323 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  58.81 
 
 		 332 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  61.13 
 
 		 318 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  57.59 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  59.18 
 
 		 330 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  55.63 
 
 		 325 aa  316  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  55.7 
 
 		 317 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  58.54 
 
 		 320 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  57.37 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  55.31 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  51.1 
 
 		 330 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  54.04 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  53.73 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  53.73 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  51.64 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  47.99 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  55.4 
 
 		 274 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  41.47 
 
 		 341 aa  256  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  50.93 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  51.6 
 
 		 308 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  49.36 
 
 		 317 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  47.34 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  50.32 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  44.31 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  55.81 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  44.69 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  36.41 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  40.28 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  35.87 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  44.16 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  46.69 
 
 		 361 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  43.57 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  47.2 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  51.27 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  44.23 
 
 		 312 aa  232  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  45.77 
 
 		 357 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  44.97 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  40.89 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  49.04 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  45.07 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  43.06 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  47.27 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  39.26 
 
 		 309 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  38.12 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  45.82 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  41.96 
 
 		 382 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  43.94 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  44.31 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  41.72 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  44.86 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  46.71 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  42.86 
 
 		 319 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  44.13 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  44.65 
 
 		 312 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  42.14 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  58.45 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  59.71 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  58.45 
 
 		 434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  58.45 
 
 		 434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  59.31 
 
 		 422 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  59.31 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  59.31 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  58.45 
 
 		 419 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  56.34 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  57.55 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  56.64 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  55.94 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  54.93 
 
 		 426 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  58.57 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  58.27 
 
 		 432 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  48.23 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 404 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  48.94 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  48.57 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  50 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  47.48 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  31.71 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  32.15 
 
 		 305 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  30.08 
 
 		 312 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  30.08 
 
 		 312 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  30.08 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  26.21 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  28.24 
 
 		 306 aa  106  7e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  28.89 
 
 		 342 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.87 
 
 		 301 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  27.87 
 
 		 301 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  27.87 
 
 		 301 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.87 
 
 		 301 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 		 359 aa  106  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  28.94 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>