More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0472 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
357 aa  684    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  93.63 
 
 
361 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  89.64 
 
 
368 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  71.43 
 
 
330 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  45.15 
 
 
421 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 
425 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  46.84 
 
 
341 aa  309  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  42.79 
 
 
433 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  46.61 
 
 
325 aa  292  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  52.82 
 
 
332 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  53.06 
 
 
323 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  46.65 
 
 
369 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  51.55 
 
 
337 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  49.39 
 
 
309 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  52.77 
 
 
365 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  49.29 
 
 
353 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  50.3 
 
 
317 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  52.37 
 
 
325 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  46.67 
 
 
355 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  54.93 
 
 
320 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  49.28 
 
 
317 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  46.33 
 
 
339 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  52.1 
 
 
274 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  45.87 
 
 
318 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  48.68 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  42.65 
 
 
307 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  46.33 
 
 
333 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  45.03 
 
 
308 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  38.11 
 
 
316 aa  189  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  51.63 
 
 
394 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  58.5 
 
 
330 aa  176  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  57.24 
 
 
387 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  59.31 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  62.25 
 
 
309 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  55.48 
 
 
416 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  55.48 
 
 
404 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  55.48 
 
 
394 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  64.75 
 
 
333 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  67.63 
 
 
338 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  56.03 
 
 
304 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  41.94 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  53.25 
 
 
434 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  52.07 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  58.99 
 
 
427 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  50.3 
 
 
434 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  50.3 
 
 
434 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  58.99 
 
 
422 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  58.27 
 
 
337 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  58.27 
 
 
422 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  58.27 
 
 
422 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  49.1 
 
 
434 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  59.72 
 
 
318 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  58.27 
 
 
345 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  57.55 
 
 
337 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  57.55 
 
 
337 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  55.8 
 
 
425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  47.65 
 
 
419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  61.22 
 
 
299 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  48.52 
 
 
430 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  61.43 
 
 
330 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  47.93 
 
 
426 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  50.36 
 
 
312 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  54.93 
 
 
432 aa  143  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  51.01 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  57.45 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  51.33 
 
 
346 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  60.16 
 
 
309 aa  135  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  54.93 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  38.79 
 
 
306 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  54.55 
 
 
351 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  47.37 
 
 
303 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  57.24 
 
 
315 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  55.94 
 
 
319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  50.7 
 
 
319 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  55.63 
 
 
317 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  55.24 
 
 
316 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  55.03 
 
 
338 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  62.14 
 
 
313 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  47.55 
 
 
324 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  54.7 
 
 
284 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  58.87 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  52.82 
 
 
312 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  27.61 
 
 
312 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  27.61 
 
 
312 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  27.61 
 
 
312 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  27.93 
 
 
398 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  23.91 
 
 
324 aa  95.9  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  28.48 
 
 
312 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  28.01 
 
 
312 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  28.48 
 
 
312 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  29.93 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  28.48 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  27.76 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  28.48 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  25.3 
 
 
298 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 
327 aa  86.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  26.18 
 
 
315 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  25.58 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  22.59 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>