More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2075 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 341 aa  700    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  70.59 
 
 		 330 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  57.29 
 
 		 421 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  56.47 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  55.18 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  62.17 
 
 		 394 aa  434  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  64.72 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  57.06 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  56.7 
 
 		 365 aa  349  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  56 
 
 		 304 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  47.62 
 
 		 312 aa  298  8e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  47.4 
 
 		 357 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  47.16 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  44.51 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  49.25 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  46.53 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  47.4 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  44.9 
 
 		 309 aa  271  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  45.51 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  44.51 
 
 		 355 aa  262  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  46.91 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  43.83 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  81.33 
 
 		 362 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  46.63 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  48.68 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  78.67 
 
 		 387 aa  248  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  45.18 
 
 		 309 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  43.43 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  79.45 
 
 		 416 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  78.77 
 
 		 404 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  78.77 
 
 		 394 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  43.43 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  42.31 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  44.75 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  41.23 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  46.06 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  44.75 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  44.68 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  42.01 
 
 		 309 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  39.36 
 
 		 316 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  41.59 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  41.82 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  42.17 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  44.04 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  41.69 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  41.79 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  45.15 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  45.51 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  41.49 
 
 		 319 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  43.44 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  42.17 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  41.77 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  42.77 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  39.41 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  42.62 
 
 		 274 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  56 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  64.08 
 
 		 387 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  48 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  37.36 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  49.29 
 
 		 427 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  46.71 
 
 		 430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  46.1 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  45.89 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  46.36 
 
 		 426 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  47.86 
 
 		 422 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  47.86 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  47.86 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  48.2 
 
 		 434 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  48.2 
 
 		 434 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 		 425 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  47.48 
 
 		 419 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  27.11 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  27.66 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  26.03 
 
 		 312 aa  106  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  26.03 
 
 		 312 aa  106  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 305 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  26.03 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  26.6 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  26.09 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  23.27 
 
 		 284 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  26.5 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  24.78 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 		 352 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  26.56 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  29.47 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  26.13 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  22.96 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>