More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4110 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  98.52 
 
 		 337 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 337 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  98.52 
 
 		 337 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  71.51 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  57.37 
 
 		 332 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  56.6 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  53.23 
 
 		 317 aa  316  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  54.86 
 
 		 355 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  57.76 
 
 		 333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  55.49 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  55.59 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  52.82 
 
 		 317 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  54.15 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  57.37 
 
 		 330 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  52.35 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  52.32 
 
 		 318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  53.61 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  86.36 
 
 		 422 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  85.71 
 
 		 422 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  85.71 
 
 		 422 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  84.21 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  82.12 
 
 		 426 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  42.05 
 
 		 341 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  81.58 
 
 		 427 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  52.62 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  50.15 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  49.23 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  48.29 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  78.81 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  40.16 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  77.48 
 
 		 434 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  78.81 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  78.15 
 
 		 434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  78.15 
 
 		 434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  44.62 
 
 		 309 aa  236  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  76.16 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  43.63 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  46.2 
 
 		 317 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  50.31 
 
 		 315 aa  229  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  42.73 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  74.17 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  44.54 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  39.62 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  43.57 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  49.65 
 
 		 315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  49.83 
 
 		 274 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  41.28 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  40.35 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  47.48 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  43.08 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  41.25 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  45.09 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  43.33 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  45.4 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  46.08 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  44.89 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  41.37 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  43.33 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  43.25 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  42.66 
 
 		 284 aa  190  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  40.94 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  75.54 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  43.03 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  44.27 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  37.15 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  41.72 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  59.57 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  50.66 
 
 		 362 aa  142  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  51.43 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 425 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 421 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  45.7 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  46.67 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  49.23 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  49.28 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  32.19 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  32.19 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.19 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.19 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  31.69 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  28.34 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  31.11 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  29.56 
 
 		 299 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  29.84 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  27.3 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  28.83 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  27.3 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  27.3 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>