More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0198 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 382 aa  758    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  73.68 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  62.57 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  59.88 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  62.13 
 
 		 319 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  62.27 
 
 		 324 aa  325  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  56.13 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  50.61 
 
 		 307 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  51.76 
 
 		 353 aa  285  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  56.85 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  52.62 
 
 		 316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  53.54 
 
 		 319 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  48.38 
 
 		 330 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  47.56 
 
 		 337 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  43.41 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  39.94 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  46.35 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  36.95 
 
 		 421 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  44.32 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  38.93 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  46.06 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  35.85 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 		 312 aa  216  5.9999999999999996e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  40.55 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  44.31 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  47.13 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  45.67 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  43.7 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  39.63 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  44.38 
 
 		 323 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  46.83 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  43.95 
 
 		 317 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  37.61 
 
 		 303 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  43.42 
 
 		 284 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  42.29 
 
 		 365 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  43.87 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  43.87 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  42.64 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  44.11 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  43.25 
 
 		 337 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  45.29 
 
 		 320 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  44.21 
 
 		 318 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 		 318 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  45.92 
 
 		 315 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  39.39 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  43.44 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  35.9 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  44.44 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  42.32 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  42.34 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  45.3 
 
 		 331 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  65.22 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  44.55 
 
 		 274 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  41.49 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  51.28 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  53.57 
 
 		 354 aa  136  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 		 362 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  46.15 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  45.14 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  45.14 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  45.14 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  42.86 
 
 		 427 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 		 425 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  39.77 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.06 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  39.77 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  47.52 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  38.6 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  38.6 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 316 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  46.81 
 
 		 422 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  46.81 
 
 		 422 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  28.06 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  51.01 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  26.4 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  47.48 
 
 		 345 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  43.75 
 
 		 346 aa  113  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 		 430 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 		 426 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  31.63 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  25.72 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  25.36 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  30.18 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.69 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  26.77 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  27.61 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  27.54 
 
 		 327 aa  104  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  27.61 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  30.81 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  25.14 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>