268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2234 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2234  putative transporter  100 
 
 		 182 aa  358  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.933876  normal  0.709489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  30.15 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  31.48 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  33.8 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  29.53 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  31.06 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  27.15 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  31.78 
 
 		 349 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  28.99 
 
 		 379 aa  64.7  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  30 
 
 		 370 aa  64.3  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  30.6 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  31.25 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  31.06 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  30.15 
 
 		 359 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  29.5 
 
 		 358 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  32.81 
 
 		 340 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  32.81 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  30 
 
 		 606 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  29.37 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  27.67 
 
 		 405 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  23.81 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  30.66 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  27.94 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  31.72 
 
 		 369 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  32.39 
 
 		 349 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  28.38 
 
 		 348 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  27.46 
 
 		 394 aa  58.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  31.19 
 
 		 360 aa  58.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  27.33 
 
 		 348 aa  57.8  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  28.26 
 
 		 668 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  27.27 
 
 		 381 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  27.54 
 
 		 675 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  28.21 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  26.95 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  28.26 
 
 		 679 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  28.82 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  28.67 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  32.39 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  32.39 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  31.3 
 
 		 650 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  31.69 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  31.69 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  31.69 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  27.21 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  23.33 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  26.95 
 
 		 420 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  28.68 
 
 		 659 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  28.46 
 
 		 387 aa  54.7  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  31.69 
 
 		 349 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  31.69 
 
 		 349 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  30.99 
 
 		 349 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  31.69 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  31.69 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  31.69 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  31.69 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  31.69 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  28.89 
 
 		 700 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  29.08 
 
 		 361 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  26.47 
 
 		 652 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  25.4 
 
 		 821 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  30.99 
 
 		 349 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  28.26 
 
 		 359 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  41.75 
 
 		 365 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  26.47 
 
 		 650 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  28.26 
 
 		 359 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  26.47 
 
 		 652 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  30.07 
 
 		 350 aa  52.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  26.14 
 
 		 644 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 		 357 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  25.74 
 
 		 649 aa  52  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  31.3 
 
 		 365 aa  52.4  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  28.08 
 
 		 663 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  25.74 
 
 		 340 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.54 
 
 		 359 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2453  hypothetical protein  28.8 
 
 		 350 aa  51.2  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  27.13 
 
 		 354 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  25.74 
 
 		 645 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  27.56 
 
 		 336 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  29.85 
 
 		 352 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  29.85 
 
 		 352 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  29.85 
 
 		 352 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  26.67 
 
 		 390 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  25.36 
 
 		 680 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 		 651 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  27.21 
 
 		 657 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  27.34 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  26.25 
 
 		 371 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  25 
 
 		 353 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  27.74 
 
 		 395 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 677 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 652 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  26.85 
 
 		 359 aa  49.3  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  27.87 
 
 		 395 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  28.99 
 
 		 680 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  26.28 
 
 		 350 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  29.32 
 
 		 379 aa  48.9  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  33.9 
 
 		 356 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  48.9  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  24.66 
 
 		 434 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.57 
 
 		 374 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>