296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03170 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_03170  pseudouridylate synthase 3 (AFU_orthologue; AFUA_3G13350)  100 
 
 		 664 aa  1382    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84338  pseudouridine synthase  32.53 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188482  normal  0.052244 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00670  pseudouridylate synthase, putative  35.34 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_3550  predicted protein  34.52 
 
 		 257 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658668  normal  0.123693 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_5217  predicted protein  33.1 
 
 		 216 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0989  tRNA pseudouridine synthase A  26.95 
 
 		 267 aa  91.7  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  26.79 
 
 		 258 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13492  tRNA pseudouridine synthase A  25.69 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.39431  normal  0.20778 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28572  predicted protein  24.71 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0301527  hitchhiker  0.000000212396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  26.12 
 
 		 273 aa  76.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2400  tRNA pseudouridine synthase ACD  24.31 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04290  pseudouridylate synthase I  35.95 
 
 		 300 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  24.34 
 
 		 246 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  26.86 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  25.1 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0770  tRNA pseudouridine synthase A  25.67 
 
 		 275 aa  70.1  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  27.56 
 
 		 252 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  27.56 
 
 		 247 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  23.95 
 
 		 248 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  23.95 
 
 		 248 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  25.34 
 
 		 246 aa  68.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  26.86 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5241  tRNA pseudouridine synthase A  23.62 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  23.82 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  27.21 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1332  tRNA pseudouridine synthase A  22.59 
 
 		 269 aa  67  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1675  tRNA pseudouridine synthase ACD  25.61 
 
 		 281 aa  66.6  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.352236  hitchhiker  0.000000344781 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  26.5 
 
 		 252 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0217  tRNA pseudouridine synthase ACD  23.04 
 
 		 276 aa  67  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  27.73 
 
 		 247 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1144  tRNA pseudouridine synthase A  25.17 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  26.5 
 
 		 247 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  26.5 
 
 		 247 aa  66.6  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  26.5 
 
 		 247 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2616  tRNA pseudouridine synthase A  27.38 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  26.5 
 
 		 247 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2159  tRNA pseudouridine synthase A  28.08 
 
 		 260 aa  66.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0844535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1115  tRNA pseudouridine synthase A  25.17 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12020  pseudouridylate synthase I  28.38 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0696  tRNA pseudouridine synthase A  26.3 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.214001  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1132  tRNA pseudouridine synthase A  25.17 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  26.64 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  27.91 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1625  tRNA pseudouridine synthase A  23.43 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875957  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  24.02 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  22.6 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.92 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  25.68 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  27.52 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0020  tRNA pseudouridine synthase A  25.31 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4968  tRNA pseudouridine synthase A  26.02 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803704  normal  0.567804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2301  tRNA pseudouridine synthase ACD  24.65 
 
 		 270 aa  63.5  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  25.27 
 
 		 262 aa  63.9  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  25.27 
 
 		 262 aa  63.9  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  25.18 
 
 		 262 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  27.62 
 
 		 262 aa  63.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  25.38 
 
 		 274 aa  63.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  27.31 
 
 		 264 aa  63.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  29.67 
 
 		 244 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  28.35 
 
 		 261 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3767  tRNA pseudouridine synthase A  22.59 
 
 		 332 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3044  tRNA pseudouridine synthase A  24.1 
 
 		 264 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0966  tRNA pseudouridine synthase A  28.28 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.982634  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  24.62 
 
 		 247 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.1 
 
 		 270 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3667  tRNA pseudouridine synthase A  25.6 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  25.57 
 
 		 270 aa  62  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.81 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1528  tRNA pseudouridine synthase A  22.32 
 
 		 286 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1555  tRNA pseudouridine synthase A  21.73 
 
 		 284 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  26.95 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1438  tRNA pseudouridine synthase A  27.07 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  25.51 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  27.48 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  25.48 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1051  tRNA pseudouridine synthase A  23.51 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1217  tRNA pseudouridine synthase A  26.46 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4870  tRNA pseudouridine synthase A  26.85 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  28.71 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21360  pseudouridylate synthase I  26.69 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0418388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  23.81 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  25.19 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  26.46 
 
 		 271 aa  60.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  25.57 
 
 		 270 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  25.57 
 
 		 270 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  25.57 
 
 		 271 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  25.57 
 
 		 270 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  25.48 
 
 		 267 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  25.78 
 
 		 289 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  25.57 
 
 		 270 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  21.43 
 
 		 285 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  25.57 
 
 		 271 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0595  tRNA pseudouridine synthase A  31.43 
 
 		 294 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  22.02 
 
 		 285 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  26.67 
 
 		 250 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  25.57 
 
 		 270 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  24.9 
 
 		 248 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0037  tRNA pseudouridine synthase A  24.16 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  23.55 
 
 		 265 aa  59.7  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3237  tRNA pseudouridine synthase A  28.22 
 
 		 274 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>