More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5217 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_5217  predicted protein  100 
 
 
216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_3550  predicted protein  45.41 
 
 
257 aa  192  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658668  normal  0.123693 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00670  pseudouridylate synthase, putative  33.81 
 
 
514 aa  160  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84338  pseudouridine synthase  39.91 
 
 
465 aa  160  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188482  normal  0.052244 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03170  pseudouridylate synthase 3 (AFU_orthologue; AFUA_3G13350)  34.88 
 
 
664 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0989  tRNA pseudouridine synthase A  32.85 
 
 
267 aa  102  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2714  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.79 
 
 
280 aa  96.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.971768  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2400  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.26 
 
 
276 aa  95.1  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  33.82 
 
 
246 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2301  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.27 
 
 
270 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0217  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.67 
 
 
276 aa  91.3  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1675  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.02 
 
 
281 aa  90.9  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.352236  hitchhiker  0.000000344781 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1332  tRNA pseudouridine synthase A  32.65 
 
 
269 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 
247 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  30.43 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  29.47 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  30.43 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  31.89 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  30.43 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  30.05 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  35.06 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  31.55 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1625  tRNA pseudouridine synthase A  28.7 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  32.52 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  33.67 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1416  tRNA pseudouridine synthase A  32.3 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  31.17 
 
 
256 aa  79  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1380  tRNA pseudouridine synthase A  33.9 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  29.35 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0964  tRNA pseudouridine synthase A  32.35 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  31.64 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  32.6 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1368  tRNA pseudouridine synthase A  32.48 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  28.8 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  27.32 
 
 
245 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  27.32 
 
 
245 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  27.32 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  27.32 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  31.15 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  27.32 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  28.65 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  31.28 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  31.86 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  26.23 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  31.28 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  31.91 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  29.26 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  30.27 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  29.26 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23260  pseudouridylate synthase I  31.71 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  32.04 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0696  tRNA pseudouridine synthase A  32.86 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.214001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  25.68 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  30.33 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  32.22 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  26.78 
 
 
245 aa  72  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1337  tRNA pseudouridine synthase A  31.11 
 
 
269 aa  71.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.354676  normal  0.497364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  32.54 
 
 
263 aa  72  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  33.15 
 
 
252 aa  72  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  28.97 
 
 
268 aa  71.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  26.23 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  30.95 
 
 
264 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  31.55 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1175  tRNA pseudouridine synthase A  32.14 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.261971  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  26.23 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  32.56 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  30.17 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  26.53 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28572  predicted protein  27.27 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0301527  hitchhiker  0.000000212396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7335  tRNA pseudouridine synthase A  31.79 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  29.51 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  31.15 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  25.12 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17411  tRNA pseudouridine synthase A  28.22 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.57 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0348  tRNA pseudouridine synthase A  31.03 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489458  normal  0.0429336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3044  tRNA pseudouridine synthase A  31.35 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  29.47 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  24.64 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17251  tRNA pseudouridine synthase A  28.78 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1219  tRNA pseudouridine synthase A  28.72 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3667  tRNA pseudouridine synthase A  30.19 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  30.16 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  30.74 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1528  tRNA pseudouridine synthase A  31.84 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141519  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  29.08 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1051  tRNA pseudouridine synthase A  28.96 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.238902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  29.21 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  28.88 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  30.46 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.39 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  31.14 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>