78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0031 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006366  plpl0031  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1271    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4592  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  45.1 
 
 		 708 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4515  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  45.33 
 
 		 708 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4390  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  45.25 
 
 		 708 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.734886 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4430  Type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  45.16 
 
 		 708 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4425  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  45.33 
 
 		 707 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.664949 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4615  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  45.16 
 
 		 708 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_20  conjugative transfer protein TraD  46.04 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0001  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  42.47 
 
 		 743 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0011  conjugal transfer protein TraD  40.83 
 
 		 723 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4308  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  40.54 
 
 		 840 aa  458  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0280519 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0076  putative type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  46.42 
 
 		 681 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0038  hypothetical protein  37.29 
 
 		 667 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.140641  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4194  hypothetical protein  30.56 
 
 		 665 aa  292  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0224168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  30.89 
 
 		 657 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6944  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  29.09 
 
 		 702 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  28.27 
 
 		 760 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5224  hypothetical protein  28.1 
 
 		 763 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440863  normal  0.967503 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5160  hypothetical protein  28.06 
 
 		 768 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3982  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  27.18 
 
 		 776 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2184  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  31.16 
 
 		 798 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2490  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.72 
 
 		 629 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1567  putative type IV secretory pathway VirD4 component  28.21 
 
 		 571 aa  183  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2425  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.08 
 
 		 616 aa  177  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146549  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3560  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  28.24 
 
 		 604 aa  177  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1111  type IV secretion system protein VirD4  30 
 
 		 509 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1821  putative type IV secretory pathway VirD4 component  29.54 
 
 		 565 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.49149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0177  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  28.71 
 
 		 578 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2352  Sigma 54 interacting domain protein  25 
 
 		 672 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7341  type IV secretion system protein VirD4  28.33 
 
 		 562 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0552655  normal  0.0313402 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6203  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.37 
 
 		 675 aa  120  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  24.2 
 
 		 602 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1687  putative type IV secretory pathway VirD4 components  24.36 
 
 		 784 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00283538  normal  0.176159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7305  hypothetical protein  23.9 
 
 		 573 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  26.76 
 
 		 608 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  25.45 
 
 		 588 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1016  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  21.01 
 
 		 602 aa  60.1  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00046304  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  22.1 
 
 		 651 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  26.44 
 
 		 569 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  24.28 
 
 		 610 aa  55.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  26.44 
 
 		 569 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0062  TraD protein, putative  29.47 
 
 		 110 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  25.33 
 
 		 590 aa  51.6  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6215  TRAG family protein  20.77 
 
 		 902 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.371474 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  27.67 
 
 		 638 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0007  hypothetical protein  22.55 
 
 		 628 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  27.67 
 
 		 638 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  23.19 
 
 		 661 aa  50.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2951  ATPase involved in conjugal plasmid transfer TRAG  34.12 
 
 		 935 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  24.16 
 
 		 661 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  22.22 
 
 		 626 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1621  hypothetical protein  23.79 
 
 		 502 aa  48.9  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  21.45 
 
 		 648 aa  48.5  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0886  hypothetical protein  31.62 
 
 		 597 aa  47.8  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.309534 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  19.33 
 
 		 714 aa  47.8  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  21.74 
 
 		 723 aa  47.8  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  18.8 
 
 		 723 aa  47.4  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  24.54 
 
 		 666 aa  47.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  20 
 
 		 625 aa  47.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  24.5 
 
 		 823 aa  46.6  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  21.18 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  22.78 
 
 		 678 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  22.45 
 
 		 998 aa  46.6  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  27.07 
 
 		 660 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  21.39 
 
 		 682 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  20.67 
 
 		 912 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  21.15 
 
 		 648 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  25.33 
 
 		 630 aa  45.4  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  24.29 
 
 		 660 aa  45.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  25.91 
 
 		 627 aa  45.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  18.57 
 
 		 641 aa  45.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  38.18 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  23.32 
 
 		 660 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  21.14 
 
 		 756 aa  44.3  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  22.54 
 
 		 700 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  20.21 
 
 		 669 aa  43.9  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  24.49 
 
 		 606 aa  43.9  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  22.79 
 
 		 662 aa  43.9  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>