41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6203 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6203  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  100 
 
 
675 aa  1383    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6944  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  28.04 
 
 
702 aa  171  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4194  hypothetical protein  25.31 
 
 
665 aa  167  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0224168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  26.96 
 
 
657 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0011  conjugal transfer protein TraD  24.18 
 
 
723 aa  130  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547678  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4308  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.84 
 
 
840 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0280519 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0038  hypothetical protein  21.77 
 
 
667 aa  121  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.140641  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1567  putative type IV secretory pathway VirD4 component  24.64 
 
 
571 aa  119  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1111  type IV secretion system protein VirD4  27.21 
 
 
509 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4515  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  23.97 
 
 
708 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115139  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4390  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  23.44 
 
 
708 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.734886 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4425  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  23.97 
 
 
707 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.664949 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4430  Type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  23.97 
 
 
708 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4615  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  23.97 
 
 
708 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4592  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  23.77 
 
 
708 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_20  conjugative transfer protein TraD  24.6 
 
 
692 aa  115  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1821  putative type IV secretory pathway VirD4 component  25.95 
 
 
565 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.49149 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0076  putative type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  22.77 
 
 
681 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2352  Sigma 54 interacting domain protein  23.32 
 
 
672 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0031  hypothetical protein  23.15 
 
 
611 aa  110  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5224  hypothetical protein  24.44 
 
 
763 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440863  normal  0.967503 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0001  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  23.68 
 
 
743 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3982  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  21.96 
 
 
776 aa  107  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2490  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.8 
 
 
629 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7341  type IV secretion system protein VirD4  26.74 
 
 
562 aa  107  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0552655  normal  0.0313402 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5160  hypothetical protein  23.59 
 
 
768 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  23.08 
 
 
760 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2425  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.74 
 
 
616 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146549  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2184  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  19.69 
 
 
798 aa  91.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0177  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  26.38 
 
 
578 aa  81.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3560  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.54 
 
 
604 aa  67  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  21.81 
 
 
602 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1016  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  24.23 
 
 
602 aa  58.9  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00046304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  20.87 
 
 
700 aa  52.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  22.71 
 
 
661 aa  47.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  23.31 
 
 
676 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  23.21 
 
 
648 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  19.12 
 
 
660 aa  45.8  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  20.87 
 
 
666 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  22.34 
 
 
663 aa  44.3  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  20 
 
 
660 aa  43.9  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>