21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1621 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1621  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1041    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2352  Sigma 54 interacting domain protein  21.3 
 
 		 672 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2425  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.55 
 
 		 616 aa  66.6  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146549  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4308  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.91 
 
 		 840 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0280519 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4425  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  23.94 
 
 		 707 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.664949 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4515  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  23.94 
 
 		 708 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4430  Type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  23.94 
 
 		 708 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_20  conjugative transfer protein TraD  23.22 
 
 		 692 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4615  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  23.94 
 
 		 708 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3982  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  25.67 
 
 		 776 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4592  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  24.3 
 
 		 708 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4390  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  24.3 
 
 		 708 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.734886 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5160  hypothetical protein  20.73 
 
 		 768 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7341  type IV secretion system protein VirD4  19.78 
 
 		 562 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0552655  normal  0.0313402 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0011  conjugal transfer protein TraD  22.83 
 
 		 723 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  24.24 
 
 		 657 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  34.85 
 
 		 602 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0031  hypothetical protein  23.79 
 
 		 611 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5224  hypothetical protein  19.71 
 
 		 763 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440863  normal  0.967503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1111  type IV secretion system protein VirD4  35.06 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0038  hypothetical protein  21.77 
 
 		 667 aa  43.9  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.140641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>