53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1016 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1016  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  100 
 
 		 602 aa  1221    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00046304  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4194  hypothetical protein  23.86 
 
 		 665 aa  88.2  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0224168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1821  putative type IV secretory pathway VirD4 component  20.63 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.49149 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3982  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.51 
 
 		 776 aa  75.5  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2352  Sigma 54 interacting domain protein  20.68 
 
 		 672 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1111  type IV secretion system protein VirD4  23.27 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5160  hypothetical protein  22.66 
 
 		 768 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2425  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  21.61 
 
 		 616 aa  69.3  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146549  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2184  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  22.98 
 
 		 798 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6944  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.1 
 
 		 702 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5224  hypothetical protein  23.18 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440863  normal  0.967503 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3560  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  21.64 
 
 		 604 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486257  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2490  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.13 
 
 		 629 aa  63.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  23.33 
 
 		 699 aa  61.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0011  conjugal transfer protein TraD  20.87 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6203  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  24.23 
 
 		 675 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1567  putative type IV secretory pathway VirD4 component  22.66 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  20.51 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0031  hypothetical protein  21.14 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1687  putative type IV secretory pathway VirD4 components  23.84 
 
 		 784 aa  55.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00283538  normal  0.176159 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7341  type IV secretion system protein VirD4  21.56 
 
 		 562 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0552655  normal  0.0313402 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_20  conjugative transfer protein TraD  19.55 
 
 		 692 aa  54.3  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  19.49 
 
 		 657 aa  53.9  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0001  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  20.17 
 
 		 743 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4308  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.22 
 
 		 840 aa  51.6  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0280519 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  22.3 
 
 		 661 aa  51.2  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  23.42 
 
 		 569 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  20.94 
 
 		 678 aa  51.2  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  21.85 
 
 		 651 aa  50.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  23.56 
 
 		 569 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4430  Type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  21.07 
 
 		 708 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4425  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  21.07 
 
 		 707 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.664949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7305  hypothetical protein  23.41 
 
 		 573 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0076  putative type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  21.18 
 
 		 681 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4592  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  22.19 
 
 		 708 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4615  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  21.07 
 
 		 708 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  19.35 
 
 		 608 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4515  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  21.7 
 
 		 708 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  21.27 
 
 		 714 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4390  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  21.07 
 
 		 708 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.734886 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  22.1 
 
 		 760 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  21.98 
 
 		 598 aa  48.5  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  23.02 
 
 		 627 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  21.55 
 
 		 648 aa  47  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  21.71 
 
 		 699 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  22.95 
 
 		 588 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4331  conjugal transfer coupling protein TraG  23.12 
 
 		 639 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  21.83 
 
 		 695 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0647  conjugal transfer coupling protein TraG  24.32 
 
 		 637 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.600969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  21.98 
 
 		 625 aa  45.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4381  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.27 
 
 		 662 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399338  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  21.89 
 
 		 723 aa  43.9  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  21.81 
 
 		 714 aa  43.9  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>