65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1403 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  653    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  62.33 
 
 		 375 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  33.42 
 
 		 622 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  32.81 
 
 		 615 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  32.84 
 
 		 568 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  32.18 
 
 		 547 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  38.33 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  38.81 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  38.65 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  30.96 
 
 		 545 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  46.84 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  28.57 
 
 		 565 aa  119  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  30.03 
 
 		 575 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  28.65 
 
 		 583 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  27.02 
 
 		 603 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  35.56 
 
 		 755 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  35.56 
 
 		 755 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  35.56 
 
 		 731 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  26.48 
 
 		 574 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  38.86 
 
 		 776 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  35.85 
 
 		 788 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  35.85 
 
 		 788 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  35.85 
 
 		 788 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  33.89 
 
 		 765 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  36.47 
 
 		 755 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  30.77 
 
 		 443 aa  87.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  32.48 
 
 		 435 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  36.71 
 
 		 482 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  34.9 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.41 
 
 		 1107 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  36.6 
 
 		 1041 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.99 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  31.02 
 
 		 763 aa  56.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  36.18 
 
 		 1015 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  38.46 
 
 		 581 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 		 440 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  32.9 
 
 		 447 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.58 
 
 		 863 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 447 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 		 437 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 		 453 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 		 421 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  24.38 
 
 		 980 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.1 
 
 		 448 aa  49.7  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.77 
 
 		 1263 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.34 
 
 		 1024 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  32.89 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 		 441 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.15 
 
 		 892 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1395 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  25.89 
 
 		 379 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.64 
 
 		 416 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  32.09 
 
 		 528 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  22.57 
 
 		 1494 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  32.31 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  34.69 
 
 		 713 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  30.96 
 
 		 1266 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  29.9 
 
 		 436 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.28 
 
 		 508 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 		 464 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  28.33 
 
 		 419 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  33.33 
 
 		 446 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  28.48 
 
 		 434 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>