125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0470 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  49.77 
 
 		 1266 aa  1295    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  49.54 
 
 		 1266 aa  1289    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  50.69 
 
 		 1266 aa  1317    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  56.92 
 
 		 1276 aa  1536    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  49.81 
 
 		 1266 aa  1295    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  56.38 
 
 		 1276 aa  1521    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  50.69 
 
 		 1266 aa  1317    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  52.37 
 
 		 1277 aa  1399    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  49.77 
 
 		 1266 aa  1295    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  54.13 
 
 		 1284 aa  1436    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  50.54 
 
 		 1265 aa  1326    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  50.65 
 
 		 1266 aa  1316    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  98.93 
 
 		 1305 aa  2575    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  49.89 
 
 		 1266 aa  1295    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  49.73 
 
 		 1266 aa  1292    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  60.56 
 
 		 1291 aa  1652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  99.31 
 
 		 1307 aa  2630    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  100 
 
 		 1307 aa  2645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  49.85 
 
 		 1266 aa  1295    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  49.85 
 
 		 1266 aa  1299    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  49.96 
 
 		 1266 aa  1295    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  50.69 
 
 		 1266 aa  1318    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  50.69 
 
 		 1266 aa  1318    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  27.65 
 
 		 1301 aa  551  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1291 aa  536  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1287 aa  534  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1266 aa  532  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1383 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1390 aa  400  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1443 aa  399  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1416 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1417 aa  390  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1417 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  23.59 
 
 		 1323 aa  386  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1436 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1392 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1301 aa  382  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1419 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1439 aa  380  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1454 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1459 aa  373  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1441 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1446 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1419 aa  347  6e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  23.27 
 
 		 1331 aa  329  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  26.49 
 
 		 1515 aa  278  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1284 aa  275  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1381 aa  249  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1307 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  25.38 
 
 		 1294 aa  244  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1265 aa  231  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1261 aa  229  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1271 aa  229  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1271 aa  228  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1283 aa  225  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1273 aa  224  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1273 aa  221  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1288 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1267 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1394 aa  212  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1341 aa  206  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1378 aa  204  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  22.8 
 
 		 1346 aa  203  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1290 aa  202  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1275 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1306 aa  202  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  23.31 
 
 		 1426 aa  198  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  21.7 
 
 		 1273 aa  196  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1277 aa  195  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1426 aa  194  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1379 aa  194  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  23.25 
 
 		 1300 aa  191  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1384 aa  185  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1420 aa  184  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  21.38 
 
 		 1441 aa  179  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1419 aa  177  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1426 aa  177  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1398 aa  172  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.77 
 
 		 1384 aa  169  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1286 aa  165  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1274 aa  165  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1141 aa  164  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  22.65 
 
 		 1283 aa  162  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.13 
 
 		 1304 aa  160  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1398 aa  155  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1398 aa  154  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1153 aa  154  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  21.42 
 
 		 1419 aa  154  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1153 aa  153  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1269 aa  151  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1264 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1399 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1399 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1399 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1399 aa  146  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  21.52 
 
 		 1472 aa  145  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1271 aa  141  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  20.34 
 
 		 1272 aa  141  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1273 aa  140  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1397 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>