More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1987 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  98.62 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  48.52 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  42.07 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  38.72 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  35.06 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  39.45 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  37.67 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  42.68 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  37.67 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  43.31 
 
 		 268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  41.72 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  34.32 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.16 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  36.82 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  36.82 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  36.87 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  43.75 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  38.15 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  34.66 
 
 		 464 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  41.46 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  38.14 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  41.84 
 
 		 751 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  32.2 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  38.26 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.59 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  33.96 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  42.71 
 
 		 550 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  39.6 
 
 		 727 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  39.6 
 
 		 727 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  32.02 
 
 		 569 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  38.35 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  41.24 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  34.75 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.75 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.75 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  34.75 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  40.21 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  34.75 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  40.71 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  40.21 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  40.21 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  33.79 
 
 		 995 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  32.87 
 
 		 491 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  35.57 
 
 		 687 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  43.14 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  42.42 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  35.29 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 590 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  30.38 
 
 		 480 aa  69.3  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  40.19 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  32.62 
 
 		 503 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  36.36 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  41 
 
 		 414 aa  68.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  32.62 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  31.91 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  39.18 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  34.43 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38.14 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  38.14 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  37.5 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  36.24 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  27.13 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  39.6 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  37.5 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31778  predicted protein  33.76 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  38.83 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  38.94 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  33.99 
 
 		 680 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  32.68 
 
 		 695 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  37.31 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  34.68 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  39.18 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  37.82 
 
 		 503 aa  67  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  32.73 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  35.65 
 
 		 513 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  36.57 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  40.21 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  33.56 
 
 		 681 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  34.02 
 
 		 538 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  30.84 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  38 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  33.33 
 
 		 437 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  37.11 
 
 		 399 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  34.29 
 
 		 1019 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  37.11 
 
 		 399 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  32.62 
 
 		 475 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  30.89 
 
 		 470 aa  65.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  32.39 
 
 		 695 aa  65.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  35.04 
 
 		 674 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  41.49 
 
 		 468 aa  65.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  37.14 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  34.86 
 
 		 457 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  32.45 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  37.14 
 
 		 430 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  38.74 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  33.81 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  33.61 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>