More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  100 
 
 
319 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  62.7 
 
 
298 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  62.16 
 
 
299 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  61.82 
 
 
299 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  53.99 
 
 
298 aa  328  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  51.71 
 
 
300 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  51.11 
 
 
300 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  50.16 
 
 
298 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  49.84 
 
 
298 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  49.53 
 
 
298 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  58.2 
 
 
268 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.44 
 
 
309 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  35.06 
 
 
290 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  35.06 
 
 
290 aa  143  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  31.05 
 
 
297 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  47.13 
 
 
281 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  34.8 
 
 
261 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  33.47 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  45.11 
 
 
293 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  39.84 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  41.32 
 
 
995 aa  82.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.15 
 
 
235 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  32.34 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  35.76 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  39.44 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  45.16 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  45.56 
 
 
824 aa  75.9  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31778  predicted protein  27.78 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  47.87 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  37.5 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  41.18 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  43.51 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  38.1 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  40.83 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  38.81 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.51 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  39.85 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  43.69 
 
 
590 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  40.5 
 
 
430 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  48.35 
 
 
360 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  44.33 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  31.17 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  48.35 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  50 
 
 
458 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  48.35 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  33.14 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  42.72 
 
 
751 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  40.86 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  38.14 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  47.87 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  45.16 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  39.82 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  40.94 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  36.19 
 
 
1019 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  40.94 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  38.69 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  40.16 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  32.09 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  35.9 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  45.16 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  34.29 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  41.98 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  34.1 
 
 
727 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  42.86 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  34.1 
 
 
727 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  46.24 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  46.24 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  35.71 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.17 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  35.88 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  40.35 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  42.55 
 
 
192 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  43.27 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  35.94 
 
 
538 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  37.07 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  33.33 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  46.59 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  44.09 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  40 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  42.06 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  38.06 
 
 
550 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  40.35 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  42.11 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  39.53 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  33.15 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  45.74 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  45.74 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  45.16 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  44.09 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  44.09 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  38.66 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  39.69 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.75 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  44.09 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0696  Peptidase M23  47.13 
 
 
487 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  31.98 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  45.45 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  43.88 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  35.37 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  37.84 
 
 
230 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>