More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01679 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01679  peptidase  100 
 
 		 281 aa  555  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  49.37 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  48.95 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  45.19 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  36.75 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  36.32 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  39.37 
 
 		 298 aa  141  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  38.84 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  47.13 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.79 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  47.33 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  47.33 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  46.67 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  45.22 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  38.74 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  43.31 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  36.59 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  34.57 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  46.15 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  34.07 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  27.41 
 
 		 995 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  42.57 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  35.04 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31778  predicted protein  34.84 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  36.71 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  34.3 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  30.34 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  37.9 
 
 		 751 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  34.58 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  45.26 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  34.3 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  42.55 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  41.24 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  34.03 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  43.43 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  33 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  43.43 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  42.55 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  43.43 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  42.55 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  42.55 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  42.27 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  36.22 
 
 		 727 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  36.04 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 754 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  36.22 
 
 		 727 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  41.49 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  30.73 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  40.21 
 
 		 569 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  40.21 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  43.01 
 
 		 430 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  36.3 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  42.27 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  31.15 
 
 		 402 aa  68.9  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.37 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  27.56 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  41.49 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5249  peptidase M23B  34.59 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.973521  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  36.43 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  40.43 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  35.2 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  37.96 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  39.36 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  36.75 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  33.06 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  35.48 
 
 		 824 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  35.05 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  34.34 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  39.18 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  40.43 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  40.43 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  40.43 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  32.64 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  40.43 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  43.33 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  38.14 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  40.43 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  33.07 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  37.11 
 
 		 480 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  40.43 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  40.43 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  38.95 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  34.07 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  39.18 
 
 		 490 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  40.43 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  40.43 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  40 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  38.54 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  33.64 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  37.12 
 
 		 198 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  40.43 
 
 		 441 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  33.64 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  37.12 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  39.36 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  30 
 
 		 470 aa  66.2  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  43.16 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  39.36 
 
 		 439 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  39.23 
 
 		 464 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  39.36 
 
 		 439 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  39.36 
 
 		 439 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>