More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_70780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  99.33 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  75.59 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  66.1 
 
 		 298 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  64.98 
 
 		 300 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  61.39 
 
 		 319 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  61.9 
 
 		 300 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  65.66 
 
 		 268 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  59.8 
 
 		 298 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  59.8 
 
 		 298 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  59.46 
 
 		 298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.14 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  36.64 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  36.48 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  36.48 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  45.22 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  36.7 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  37.17 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  39.87 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  35.76 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  37.31 
 
 		 995 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  38.35 
 
 		 550 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  34.84 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  45.54 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  42.57 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  40 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.45 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  41.58 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.03 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  43.69 
 
 		 590 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  40.31 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  45.56 
 
 		 751 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.89 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  40.19 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  39.53 
 
 		 538 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  36.13 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  44.09 
 
 		 727 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  37.31 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  44.09 
 
 		 727 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  39.25 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  43.01 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  42.99 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  39.5 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  41 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  45.16 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0197  peptidase M23B  39.69 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00125912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0203  peptidase M23B  39.69 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  44.68 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  43.81 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  31.55 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  38 
 
 		 446 aa  69.3  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  38.1 
 
 		 507 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  39.82 
 
 		 486 aa  69.3  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  43.33 
 
 		 824 aa  68.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  32 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  30.63 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  41.76 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  38.53 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  38.66 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  30.63 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  35.71 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  43.01 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  30.06 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  35.71 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  34.29 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  39.25 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31778  predicted protein  28.48 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  43.62 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  39.78 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  37.9 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  33.93 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  37.5 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  36.05 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  39.78 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  38.89 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  43.14 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  37.17 
 
 		 470 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  38.94 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  35.94 
 
 		 443 aa  66.2  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  35.92 
 
 		 1019 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  36.29 
 
 		 419 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  36.29 
 
 		 440 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  36.29 
 
 		 440 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  36.29 
 
 		 440 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  36.29 
 
 		 440 aa  65.9  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  36.29 
 
 		 440 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  36.29 
 
 		 440 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  36.36 
 
 		 423 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  36.29 
 
 		 440 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  36.29 
 
 		 440 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.03 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  38.71 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  39.09 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  41.94 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  34.85 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  34.78 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  36.79 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  41.94 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  32.52 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  41.94 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>