More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03923 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  100 
 
 		 293 aa  604  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  56.77 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.77 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  32.27 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  46.15 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  51.33 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  51.33 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  43.75 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  43.75 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  36.48 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  49.56 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  32.79 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  44.44 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  45.11 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  38.76 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  46.21 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  39.87 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  39.87 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  42.66 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  42.96 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  34.44 
 
 		 995 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  38.97 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  31.98 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  32.56 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  32.56 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  42.71 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  44.21 
 
 		 751 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  37.6 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  39.34 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  39.82 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  36.07 
 
 		 486 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  39.82 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  44.21 
 
 		 533 aa  72.4  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  40 
 
 		 569 aa  72.4  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  42.11 
 
 		 727 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  42.11 
 
 		 727 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31778  predicted protein  39.2 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  36.07 
 
 		 440 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  36.29 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  36.07 
 
 		 441 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  36.77 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  35.77 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  35.77 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  35.77 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  35.77 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  35.77 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  36.07 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  35.77 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  35.77 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  35.77 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  35.77 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  35.48 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  37.4 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  36.89 
 
 		 438 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  36.89 
 
 		 438 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  36.89 
 
 		 410 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  36.45 
 
 		 439 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  44.12 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  36.36 
 
 		 470 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  34.96 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  35.2 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  37.12 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  34.96 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  39.8 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  34.96 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  37.4 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  41.05 
 
 		 590 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  34.96 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  31.52 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  36.13 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  34.96 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  41.82 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  38.52 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  35.47 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  32.23 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  43.16 
 
 		 754 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  38.71 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  40.38 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  41.82 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  37.7 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  34.92 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  37.5 
 
 		 674 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  33.6 
 
 		 439 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  39.09 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  36.51 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  34.19 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  40.78 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  36.69 
 
 		 429 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  35.48 
 
 		 695 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  37.37 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  41.18 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  33.74 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  27.73 
 
 		 687 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  37.62 
 
 		 498 aa  66.2  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  36.89 
 
 		 1019 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  41.23 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  36.31 
 
 		 400 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  36.13 
 
 		 439 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  36.31 
 
 		 421 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  35.83 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>