More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1475 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  100 
 
 		 309 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  38.83 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  38.41 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  40.22 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  40.22 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  35.28 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  38.75 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  33.44 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  39.46 
 
 		 268 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  36.77 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  36.08 
 
 		 298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  36.77 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  34.62 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  45.28 
 
 		 281 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  34.16 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  34.16 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  36.36 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  39.77 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  45.39 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  28.15 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  31.46 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  38.74 
 
 		 751 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  35.77 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  40 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  37.9 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  41.24 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  31.3 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  39.18 
 
 		 727 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  39.18 
 
 		 727 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  41.49 
 
 		 590 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  36.73 
 
 		 538 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  33.33 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  29.08 
 
 		 995 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  35.71 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  38.94 
 
 		 582 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  29.76 
 
 		 198 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  29.76 
 
 		 198 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  41.24 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  30.71 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  42.27 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  42.27 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  42.27 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  33.77 
 
 		 569 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  41.24 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  33.33 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  34.29 
 
 		 223 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  34.68 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  42.57 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  39.13 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  39.13 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  36.29 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  41.59 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.52 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  40.21 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  40.21 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  40.21 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  36.08 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  42.27 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  37.76 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  37.1 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  33.88 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  37.76 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  33.08 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  32.91 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  38.02 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  42.27 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  32.03 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  40.21 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  36.73 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  26.57 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  36.73 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  31.72 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  23.35 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  40.21 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 577 aa  63.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  33.33 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  33.88 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  39.36 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  40.21 
 
 		 499 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.86 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  41.49 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  41.49 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  41.49 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  40.62 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  27.41 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  37.17 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  38.61 
 
 		 460 aa  62.8  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  35.82 
 
 		 420 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  35.82 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  30.61 
 
 		 530 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  30.61 
 
 		 534 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  40.21 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  35.82 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  31.18 
 
 		 441 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  37.17 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  36.17 
 
 		 468 aa  62.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  33.08 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  34.11 
 
 		 423 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>