More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3052 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  42.07 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  40.61 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  42.97 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  38.36 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  37.38 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  37.44 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  34.39 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  36.7 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  36.7 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  36.91 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  37.34 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.51 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  36.91 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  37.21 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  35.71 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  33.06 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  38.76 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  43.54 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  38.65 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  36.17 
 
 		 995 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  37.39 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  38.6 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  38.61 
 
 		 538 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  37.96 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  39.8 
 
 		 569 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  39.8 
 
 		 727 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  39.8 
 
 		 727 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  41.05 
 
 		 751 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  40.62 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  32.17 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  36.96 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  37.5 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  39.58 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  38.38 
 
 		 486 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  38.38 
 
 		 470 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  38.54 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  39.39 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  33.96 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  35.71 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  42.42 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  34.29 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  35.71 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  37.76 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  37.76 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  36.73 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  37.76 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  37.76 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  35 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  37 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  37.76 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  32.08 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  37.37 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  34.65 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  33.02 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  37.37 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  37.37 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  37.37 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  41.84 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  37.37 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  36.36 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  38 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.84 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  36.73 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  35.78 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.71 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  36.36 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  36.36 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  36.36 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  36.36 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  36.36 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  34.65 
 
 		 484 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  36.36 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  36.36 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  36.36 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  35.05 
 
 		 441 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  38.24 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.71 
 
 		 473 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  36.89 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  28.37 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  26.79 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  36.73 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  33.67 
 
 		 480 aa  59.3  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  34.65 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  37.37 
 
 		 439 aa  58.9  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35.71 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  33.91 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35.71 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  33.04 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  37.62 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  35.05 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  34.65 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  39 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  36.36 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  36.73 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  35.71 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  36.45 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  37.76 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  40.62 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  35.64 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>