More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5480 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  100 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  94.78 
 
 		 300 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  62.78 
 
 		 298 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  66.04 
 
 		 299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  64.42 
 
 		 298 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  65.66 
 
 		 299 aa  354  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  59.18 
 
 		 300 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  59.4 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  59.02 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  58.65 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  58.2 
 
 		 319 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.46 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  35.62 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  35.9 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  43.31 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  43.31 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  38.36 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  40.11 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  42.66 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  40.28 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  31.09 
 
 		 995 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  44 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  40.35 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  46.24 
 
 		 727 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  46.24 
 
 		 727 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  44.25 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  42.86 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  44.44 
 
 		 751 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  39.69 
 
 		 824 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 590 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.92 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  40.54 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  37.98 
 
 		 550 aa  72  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  35.23 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31778  predicted protein  32.35 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  39.32 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  40.68 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  40.68 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  37.93 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  39.83 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.68 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  45.16 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  33.33 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  37.4 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  36.52 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  41.51 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  43.43 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  33.71 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  34.68 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  43.43 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  34.68 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  43.43 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  46.24 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  42.39 
 
 		 490 aa  69.7  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  37.4 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  44.79 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  39.2 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  39.5 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  39.5 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  39.5 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  37.76 
 
 		 439 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  34.96 
 
 		 451 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  39.5 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  39.5 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  39.5 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  39.5 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  34.96 
 
 		 446 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  39.5 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  34.96 
 
 		 455 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  39.5 
 
 		 419 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  32.47 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  32.47 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  47.31 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  40.34 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  40.43 
 
 		 538 aa  68.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  36.27 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  39.62 
 
 		 582 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  40.22 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  38.98 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  37.5 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  34.08 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  39.02 
 
 		 507 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  33.93 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0197  peptidase M23B  37.5 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00125912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0203  peptidase M23B  37.5 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  40.22 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  41.49 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  43.81 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  31.9 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  41.49 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  30.74 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  34.96 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  47.13 
 
 		 441 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  47.13 
 
 		 431 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  42.72 
 
 		 486 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  40.17 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  35.04 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.82 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  36.3 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  38.98 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>