More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1689 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  100 
 
 		 261 aa  548  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  56.77 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  35.42 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.36 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  32.32 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  36.04 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  37.7 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  34.8 
 
 		 319 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  37.17 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  39.2 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  40.68 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  40.11 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  34.57 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  41.83 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  42.48 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  44.83 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  28.1 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  38.15 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  38.15 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  43.54 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  35.71 
 
 		 995 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  39.5 
 
 		 440 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  35.43 
 
 		 470 aa  72  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  37.31 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  37.19 
 
 		 441 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  36.36 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  34.65 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  37.01 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  37.01 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  38.33 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  37.01 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  37.01 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  37.01 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  37.01 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  37.01 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  37.01 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  37.01 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  37.8 
 
 		 439 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  37.8 
 
 		 439 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  37.8 
 
 		 439 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  37.8 
 
 		 439 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  37.8 
 
 		 439 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  31.33 
 
 		 386 aa  68.9  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  31.33 
 
 		 386 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  31.33 
 
 		 386 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  37.8 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  33.09 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  42.11 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31778  predicted protein  32.82 
 
 		 361 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  32.56 
 
 		 346 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  38.66 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  38.66 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  37.27 
 
 		 751 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  38.02 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  33.97 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  35 
 
 		 507 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  32.05 
 
 		 439 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  39.81 
 
 		 569 aa  65.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  32.61 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  38.61 
 
 		 352 aa  65.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  32.35 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  34.09 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  40.19 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  32.47 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  26.17 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  34 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  36.08 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  30.94 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  39 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  38.95 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  36.22 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  36.22 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  36.46 
 
 		 533 aa  62.4  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  38.78 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  36.22 
 
 		 437 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  35.19 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  39.36 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  37.89 
 
 		 457 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  36.15 
 
 		 299 aa  62  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  37.89 
 
 		 477 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.92 
 
 		 477 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  38.95 
 
 		 300 aa  62  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  38.95 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  42.11 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  32.8 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  37.14 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  30.83 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.04 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  39.58 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  37.76 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  37.76 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.38 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  30.77 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  37.23 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  37.89 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  37.74 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  29.44 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  39.78 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  37.74 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  38.46 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>