More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2234 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  100 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  40.85 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  41.71 
 
 		 502 aa  159  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0464  peptidase M23B  94.2 
 
 		 74 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0199916  hitchhiker  0.00350972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  35.59 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  34.62 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  34.62 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.84 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27670  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.62 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  34.27 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  30.81 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  33.15 
 
 		 399 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  33.86 
 
 		 362 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  33 
 
 		 398 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  33.82 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  34.87 
 
 		 424 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  32.97 
 
 		 409 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  28.97 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  25.51 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  28.66 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  33.54 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  31.68 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  32.3 
 
 		 187 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  31.68 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  32.92 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  32.92 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  32.92 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1717  cell wall endopeptidase  32.92 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402348  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3404  Peptidase M23  27.98 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  31.68 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  40 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  30.39 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  31.21 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  35.77 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6259  Peptidase M23  31.87 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485379  normal  0.820011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0942  peptidase M23B  30.83 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0501696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3898  Peptidase M23  27.03 
 
 		 442 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0247447  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  31.85 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  31.33 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  30.46 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  35.85 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  36.96 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  30.67 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  34.91 
 
 		 450 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  36.96 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  33.02 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  33.64 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  35.45 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  35.71 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  34.82 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  36.84 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  33.02 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  33.02 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  33.93 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  40.24 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  37.89 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  50.88 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  37.76 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1462  peptidase M23B  41.98 
 
 		 111 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0490484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  50.88 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  35.71 
 
 		 538 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  32.73 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  43.06 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  27.98 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  34.74 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  30.97 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  32.74 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  35.79 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  36.84 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  32.82 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  27.98 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  41.77 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  36.84 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  39.51 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  33.68 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  35.51 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  35.79 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  36.84 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  32 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  40.51 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  43.86 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  36.73 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  36.46 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  36.84 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  36.84 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.43 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0048  TraG  39.34 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000012382  normal  0.663313 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 590 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  35.19 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  45.07 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7968  Peptidase M23  28.46 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  47.27 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  33.68 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  35.79 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  35.19 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1148  phage-associated peptidase  37.23 
 
 		 979 aa  56.6  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.602861  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  41.77 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  31.58 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  36.84 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  40.62 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>