264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4533 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  36.71 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.46 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  35.43 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  34.29 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  34.66 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  35.23 
 
 		 268 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  35.43 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  35.43 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  35.43 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  34.29 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  32.57 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  34.29 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  32.73 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  35.22 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  34.29 
 
 		 299 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  32.73 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  32.61 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  31.11 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  28.81 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1743  Peptidase M23  36.03 
 
 		 646 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  34.23 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  28.77 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  30.71 
 
 		 317 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  35.59 
 
 		 367 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  29.79 
 
 		 331 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  32.43 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  34.65 
 
 		 454 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  26.62 
 
 		 484 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  34.29 
 
 		 450 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0592  M23/M37 familypeptidase  38.02 
 
 		 282 aa  52  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  34.29 
 
 		 345 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  26.85 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  35.04 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  33.33 
 
 		 332 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  29.86 
 
 		 395 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  33.66 
 
 		 457 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  36.36 
 
 		 669 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  34.82 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  29.63 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  34.21 
 
 		 404 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  32.74 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  28 
 
 		 325 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  36.97 
 
 		 300 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  30.14 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  35 
 
 		 630 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  42.65 
 
 		 435 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  26.62 
 
 		 478 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  32.84 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  32.84 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  36.21 
 
 		 288 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  26.62 
 
 		 464 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  32.67 
 
 		 457 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  34.21 
 
 		 399 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  32.67 
 
 		 457 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  33.33 
 
 		 340 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  47.54 
 
 		 439 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  38.82 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  25.9 
 
 		 474 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  38.79 
 
 		 283 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  28.06 
 
 		 471 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  35.25 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 399 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  34.21 
 
 		 425 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  35.96 
 
 		 430 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  34.21 
 
 		 420 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  47.54 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1247  Peptidase M23  45 
 
 		 791 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  35.34 
 
 		 411 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  34.21 
 
 		 400 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  39.68 
 
 		 430 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  41.67 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  41.98 
 
 		 435 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  45.76 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  28.47 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  37.8 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  28.15 
 
 		 509 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  33.91 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  34.21 
 
 		 421 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1006  Peptidase M23  36.96 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  36.17 
 
 		 436 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2907  peptidase M23B  27.68 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.419001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  40 
 
 		 482 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  43.48 
 
 		 592 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  34.21 
 
 		 421 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  32.46 
 
 		 299 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  29.2 
 
 		 527 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  37.07 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  33.63 
 
 		 419 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  33.63 
 
 		 440 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  36.04 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  33.63 
 
 		 440 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  33.63 
 
 		 440 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  33.63 
 
 		 440 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  33.63 
 
 		 440 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  30.37 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  33.33 
 
 		 412 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  44.62 
 
 		 597 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  33.63 
 
 		 440 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  30.43 
 
 		 318 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>