More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_31778 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_31778  predicted protein  100 
 
 
361 aa  751    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31218  predicted protein  55.94 
 
 
207 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  34.84 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  27.78 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  32.43 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  32.35 
 
 
268 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  30.87 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  29.73 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  39.2 
 
 
293 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  29.73 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  29.73 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  26.79 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  33.76 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  29.73 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  33.76 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  28.48 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  32.82 
 
 
261 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  28.48 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  33.33 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  38 
 
 
440 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  35.2 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  35.58 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.75 
 
 
309 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  31.1 
 
 
995 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  33.65 
 
 
419 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  32.65 
 
 
273 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  36 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  33.65 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  33.65 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  33.65 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  33.65 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  33.65 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  33.65 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.67 
 
 
244 aa  57  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  36 
 
 
438 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  33.65 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  36 
 
 
438 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  33.65 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  32.69 
 
 
439 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  31.43 
 
 
439 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  32.69 
 
 
439 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  32.69 
 
 
439 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  32.69 
 
 
439 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  32.69 
 
 
439 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  33.33 
 
 
352 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  33.83 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  34.69 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  36.63 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  32.65 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  33.66 
 
 
470 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  34.45 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  34.69 
 
 
431 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  34.69 
 
 
431 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  31.25 
 
 
255 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  28.67 
 
 
441 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  30.07 
 
 
402 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  34.69 
 
 
431 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  34.69 
 
 
434 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  33.6 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  33 
 
 
440 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  36.73 
 
 
439 aa  53.1  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  29.75 
 
 
398 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  29.29 
 
 
498 aa  53.1  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  33.67 
 
 
431 aa  52.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  31.06 
 
 
464 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  33.67 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  33.67 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  31.25 
 
 
438 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  33.67 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  33.67 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.96 
 
 
235 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  34.65 
 
 
474 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  34.69 
 
 
424 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  37 
 
 
538 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.66 
 
 
475 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  30.69 
 
 
486 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  31.25 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  34.69 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  30.61 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  30.84 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  30.61 
 
 
285 aa  50.8  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  28.47 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  30.3 
 
 
470 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  30.61 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  31.31 
 
 
439 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  28.07 
 
 
325 aa  50.4  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  30.61 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  32.65 
 
 
404 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  30.3 
 
 
462 aa  50.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  35.35 
 
 
290 aa  49.7  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  31.43 
 
 
290 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  26.69 
 
 
387 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  35.35 
 
 
316 aa  49.7  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  33.33 
 
 
299 aa  49.7  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  32.04 
 
 
389 aa  49.7  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  31.63 
 
 
433 aa  49.3  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  34.34 
 
 
328 aa  49.3  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.32 
 
 
316 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  33.33 
 
 
319 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  31.31 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>