285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1935 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1935  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 404 aa  844    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.100874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0505  Radical SAM domain protein  58.92 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.143613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.27 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  33.11 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 501 aa  72.8  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  34.51 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  31.69 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.7 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.31 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  30.07 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  30.28 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  29.3 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  33.59 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  33.56 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  30.13 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  31.45 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  30 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.94 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  28.8 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  28.31 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.23 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.92 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  30.07 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  27.34 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.03 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  28.4 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  27.97 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0881  radical SAM family Fe-S protein  23.12 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.730435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2102  Radical SAM domain protein  22.84 
 
 		 548 aa  57  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  24.18 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  27.52 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  31.11 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>