74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1731 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  100 
 
 		 172 aa  357  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0156  Ricin B lectin  46.31 
 
 		 187 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151088  normal  0.0518201 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  34.13 
 
 		 806 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  31.65 
 
 		 806 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 		 806 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  31.65 
 
 		 806 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  31.65 
 
 		 806 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 		 806 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  31.65 
 
 		 806 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  31.65 
 
 		 806 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  29.7 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  25.79 
 
 		 476 aa  67.8  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  32.33 
 
 		 726 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  28.85 
 
 		 482 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  24.68 
 
 		 494 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  30.66 
 
 		 672 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  26.92 
 
 		 1016 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  29.71 
 
 		 963 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.66 
 
 		 1567 aa  58.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  27.34 
 
 		 487 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  28.08 
 
 		 800 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  28.08 
 
 		 800 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  28.08 
 
 		 807 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  28.08 
 
 		 805 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 		 858 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 		 858 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  28.67 
 
 		 858 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 1148 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  32.33 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  27.66 
 
 		 474 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 510 aa  55.1  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  27.54 
 
 		 436 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 503 aa  54.3  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  31.01 
 
 		 748 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  27.42 
 
 		 1049 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6476  Ricin B lectin  25.76 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  29.77 
 
 		 465 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  27.62 
 
 		 240 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  26.77 
 
 		 566 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  23.65 
 
 		 644 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  28.24 
 
 		 582 aa  52  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  28.38 
 
 		 794 aa  50.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  24.64 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  27.08 
 
 		 943 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  25 
 
 		 368 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  26.02 
 
 		 507 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  22.54 
 
 		 737 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7940  hypothetical protein  27.78 
 
 		 573 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  26.79 
 
 		 412 aa  47.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 824 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  24.18 
 
 		 897 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  26.53 
 
 		 618 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.19 
 
 		 537 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  26.21 
 
 		 1577 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.88 
 
 		 756 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  26.52 
 
 		 1222 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  29.87 
 
 		 275 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  28.57 
 
 		 411 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  22.56 
 
 		 514 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  29.03 
 
 		 497 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.14 
 
 		 507 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  27.95 
 
 		 514 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  24.35 
 
 		 576 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  24.64 
 
 		 663 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  29.17 
 
 		 423 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  32.05 
 
 		 1347 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  24.39 
 
 		 507 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  27.87 
 
 		 569 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  23.73 
 
 		 571 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  32.14 
 
 		 1000 aa  42  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  42.11 
 
 		 1100 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  23.62 
 
 		 789 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  24.32 
 
 		 1259 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  27.5 
 
 		 840 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>