More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1222 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  37.77 
 
 		 1241 aa  779    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  52.65 
 
 		 1204 aa  1209    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  60.78 
 
 		 1162 aa  1285    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  55.35 
 
 		 1228 aa  1268    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  52.37 
 
 		 1209 aa  1187    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  64.6 
 
 		 1172 aa  1513    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  77.8 
 
 		 1176 aa  1815    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  52.64 
 
 		 1226 aa  1241    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  54.08 
 
 		 677 aa  695    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  50.78 
 
 		 1212 aa  1034    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  56 
 
 		 1488 aa  827    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  57.06 
 
 		 1201 aa  1280    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  46.01 
 
 		 1822 aa  1062    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  57.79 
 
 		 1233 aa  1304    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  71.68 
 
 		 1182 aa  1698    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  56.23 
 
 		 1204 aa  1338    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  70.19 
 
 		 1243 aa  1749    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  60.1 
 
 		 1205 aa  1416    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  53.59 
 
 		 1210 aa  1252    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  55.56 
 
 		 1200 aa  1290    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  56.49 
 
 		 1209 aa  1322    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  56.72 
 
 		 1238 aa  1248    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  52.82 
 
 		 1206 aa  1264    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  53.02 
 
 		 1207 aa  1181    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  55.44 
 
 		 1212 aa  1323    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  52.12 
 
 		 1201 aa  1165    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  100 
 
 		 1180 aa  2390    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  53.22 
 
 		 1203 aa  1220    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  56.73 
 
 		 1203 aa  1308    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  53.29 
 
 		 1205 aa  1160    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  55.56 
 
 		 1197 aa  1264    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  77.17 
 
 		 1179 aa  1767    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  52.57 
 
 		 1204 aa  1204    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  51 
 
 		 1208 aa  1150    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  52.07 
 
 		 1204 aa  1148    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  52.82 
 
 		 1209 aa  1244    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  77.37 
 
 		 1176 aa  1805    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  51.37 
 
 		 663 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  71.62 
 
 		 1183 aa  1707    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  56.96 
 
 		 1205 aa  1293    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  77.03 
 
 		 1179 aa  1838    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  57.77 
 
 		 1203 aa  1332    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  71.3 
 
 		 1183 aa  1697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  53.29 
 
 		 1205 aa  1156    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  52.09 
 
 		 1220 aa  1135    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  76.16 
 
 		 1179 aa  1826    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  52.55 
 
 		 1231 aa  1222    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  56.79 
 
 		 1205 aa  1306    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  56.81 
 
 		 1205 aa  1298    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  53.29 
 
 		 1205 aa  1156    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  53.34 
 
 		 1197 aa  1226    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  53 
 
 		 1201 aa  1228    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  53.96 
 
 		 1204 aa  1134    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  52.12 
 
 		 1234 aa  1154    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  56.81 
 
 		 1205 aa  1298    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  52.66 
 
 		 1200 aa  1224    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  55.14 
 
 		 1208 aa  1332    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  51.88 
 
 		 665 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3703  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.81 
 
 		 662 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2379  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.03 
 
 		 682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3635  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.81 
 
 		 662 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3630  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  51.81 
 
 		 662 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2167  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.46 
 
 		 682 aa  406  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0175  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.76 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4148  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.43 
 
 		 448 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.21 
 
 		 752 aa  406  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3756  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.89 
 
 		 682 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0388867  normal  0.0417354 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.68 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.98 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2802  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.46 
 
 		 684 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2131  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.23 
 
 		 682 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2515  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.44 
 
 		 682 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370768  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.32 
 
 		 671 aa  400  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.14 
 
 		 445 aa  399  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2043  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.46 
 
 		 682 aa  399  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3403  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.46 
 
 		 696 aa  399  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1853  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.23 
 
 		 682 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1878  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  44.57 
 
 		 673 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3000  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.08 
 
 		 669 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3370  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  42.47 
 
 		 680 aa  398  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1874  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.97 
 
 		 669 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  48.38 
 
 		 654 aa  396  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.89 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3181  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.67 
 
 		 667 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.45 
 
 		 445 aa  396  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1318  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4003  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50.7 
 
 		 667 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.666441  normal  0.37304 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2356  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.22 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488234  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1017  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  49.89 
 
 		 675 aa  395  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.848501 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.45 
 
 		 445 aa  396  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.79 
 
 		 670 aa  396  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  49.66 
 
 		 673 aa  395  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1395  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.42 
 
 		 448 aa  396  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1404  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.16 
 
 		 733 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000354677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0385  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.81 
 
 		 671 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  43.4 
 
 		 676 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2604  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.45 
 
 		 445 aa  396  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.189257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  51.28 
 
 		 670 aa  396  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>