More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4818 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  78.88 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  76.45 
 
 		 244 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  78.88 
 
 		 246 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  78.02 
 
 		 237 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  65.52 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  65.09 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  62.93 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  61.21 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  63.36 
 
 		 238 aa  291  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  59.41 
 
 		 239 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  59.05 
 
 		 236 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  59.91 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  57.69 
 
 		 237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  58.19 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  59.83 
 
 		 233 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  54.31 
 
 		 237 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  56.22 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  56.03 
 
 		 240 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  52.16 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  51.07 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.07 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  48.94 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  47.84 
 
 		 232 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  48.73 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  46.67 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.68 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  51.05 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.98 
 
 		 234 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  53.07 
 
 		 235 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  47.44 
 
 		 234 aa  218  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  48.46 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  48.46 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  48.94 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  46.55 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  47.41 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.98 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.46 
 
 		 231 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  50.21 
 
 		 230 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.98 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  46.98 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  46.98 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.55 
 
 		 236 aa  214  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  48.72 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  48.71 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.98 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.98 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.98 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  49.15 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  46.12 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  47.21 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  47.01 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  45.96 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.69 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  44.08 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  44.68 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  46.55 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  43.83 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  43.15 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  43.72 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  43.83 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  44.81 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  43.97 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  47.01 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  45.06 
 
 		 240 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  45.69 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  42.98 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  41.56 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.28 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  44.68 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  42.73 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  46.25 
 
 		 739 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  47.64 
 
 		 236 aa  195  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 233 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  42.31 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  41.81 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  42.74 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  43.86 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  45.49 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  42.37 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  42.24 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  44.83 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  43.7 
 
 		 232 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  45.53 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  45.53 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  44.07 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  41.45 
 
 		 233 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  45.53 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  41.77 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  43.53 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  40.5 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  44.93 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>