224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3037 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  73.03 
 
 		 302 aa  231  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  70 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  73.79 
 
 		 317 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 303 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2448  hypothetical protein  96.3 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 313 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  47.3 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  47.3 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  47.22 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  45.27 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  43.24 
 
 		 314 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  43.92 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 326 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 296 aa  128  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 300 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  40.14 
 
 		 331 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  39.61 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  43.31 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0808  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 151 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 308 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  40.97 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2407  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0930  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2169  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2874  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 208 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41333  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0696  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1134  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1344  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1900  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4974  transcriptional regulator, LysR family  29.38 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2402  LysR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000498795  hitchhiker  0.00000317768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3246  transcriptional regulator, LysR family  28.14 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0761  transcriptional regulator, LysR family  28.24 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.211674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0907  transcriptional regulator, LysR family  28.24 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 306 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4211  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425725 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 296 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1491  LysR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40910  LysR family transcriptional regulatory protein  27.52 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1220  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  26.72 
 
 		 306 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  26.72 
 
 		 306 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  28.83 
 
 		 298 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 302 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 323 aa  48.5  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3084  transcriptional regulator, LysR family  26.81 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  30.4 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  30.4 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0866  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5839  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0989  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179593 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4305  LysR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 328 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 328 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>