12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2448 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2448  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  503  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  96.3 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3038  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 		 128 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.207805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2112  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390648 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3561  hypothetical protein  23.79 
 
 		 200 aa  85.1  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3411  hypothetical protein  42 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0908  hypothetical protein  24.7 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0498  hypothetical protein  23.08 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0512  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.389095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0693  hypothetical protein  38 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0221163  hitchhiker  0.00013899 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1551  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>